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急救医学博导江晓琪美国学成归来，逛街时遭遇抢劫，没想到抢她的少年劫匪突然昏倒在地。江晓琪立刻送他至XX医院急诊。在分诊台，她遇到了正在指挥为受伤的农民工进行截肢手术的急诊科最具学术权威的主任医师何建一，两人出于中美不同的急救观念争执起来。也就在这一天，一名精神分裂者在急诊室门外持刀闹事导致了一名医生惨死，难脱干系的何建一悲痛万分。江晓琪来到急诊室工作，很快凭着高超医术和对患者人性的关怀在医院上下赢得了很多年轻同事的崇拜。一直觊觎急救科主任位置的副主任刘慧敏，本来以为最大的竞争对手是何建一，不想天降江晓琪，内心对江晓琪的做派各种不满，何建一却对江晓琪抱着审视的目光。江晓琪和何建一在工作中，看到对方的善良、能力和医术，也看到了自己的不足，两个人不断被对方改变着并渐生情愫。
乔娜焦急地向何建一汇报，留观病房里有几个病人出现发烧症状，儿科也有好几个人发烧，她担心是流感。何建一去查房后发现情况果真如此，他的眉头越皱越紧。很快何建一在办公室叫住江晓琪和刘慧敏，他把医院集体发烧现象告诉她们，他认为这是院内感染。江晓琪却怀疑是超级细菌，如果真是这样那将是非常严重和可怕的。三人一合计决定马上向院领导汇报。
党珍妮为了瓦解张梅带的那帮医闹，她故意让食堂师傅推着卖饭的车在医闹中间穿梭。饭菜的香味让医闹们更加得饥肠辘辘，他们要求张梅管饭，张梅却不管不顾。医闹们顿时和张梅争吵起来，最后张梅不情不愿地给医闹们买了盒饭。
何建一通知急诊科所有医护人员加班，他们先是在会议室集中开会。何建一把出现超级细菌的事告诉大家，这是一种滥用抗生素后产生的抗药细菌，一旦爆发无药可医。众人作为专业的医护人员，他们迅速商量出处理办法。很快全科人员都动手消毒，更换新的制服以及及时对病患隔离和治疗。整个急诊科如战场一样严阵以待。
江晓琪和何建一下班时正讨论医院细菌感染的事，江晓琪看到秦宇宁坐在急诊科的长椅上等她。秦宇宁把江晓琪带到自己车上，他把从公安局、消防队等处调查来的资料出示给江晓琪看。江晓琪顿时无语，她急切地解释称自己并不是想了解火灾真相，秦宇宁完全不明白自己想要什么。秦宇宁又称郑岚已经答应可以把专利让给江晓琪，江晓琪越发觉得秦宇宁完全不理解自己。她愤然下车摔上车门，秦宇宁恼怒沮丧极了。
医闹两个头目发现救护车到了门口却又离开，他们看到党珍妮和救护车司机窃窃私语，似乎有什么秘密。医闹头目把党珍妮叫到一旁，讨好地问她到底发生什么事。党珍妮故作神秘地告诉他们，急诊科爆发超级细菌，医闹头目吓坏了。这时张梅正在急诊科情绪激动地接受记者采访，赵蕾义正辞严地陈清张梅母亲生病治疗的经过。双方各执一词真伪难辩。这时医闹头目悄悄地把超级细菌的事告诉其他医闹，众医闹脸色大变，无不惊惶失措。他们赶紧起身准备离开。
张梅看到医闹们要走，她脱口而出称如果他们走了自己就不会给他们钱。此话顿时在记者们中炸了锅，记者立马调转话筒问张梅到底什么意思。医闹头目这时干脆直言相告，称他们是张梅请来的，而且到目前分文未付。医闹们吵着要离开，张梅顿时崩溃绝望地昏迷过去。等张梅醒来时发现江晓琪和王子桥正在为她诊治，被她打过的张泠正尽职尽责地为她注射药物。张梅终于良心发现地向张泠道歉。
医闹事件过后，赵蕾给急诊科的医护人员开会通报这次事故的调查经过和处理结果。最终赵蕾通报给江晓琪扣发当月奖金的处理，江晓琪解释了当日的情况却无济于事。接着赵蕾又根据这次事件给急诊科定下几个规定。赵蕾宣布完了问了大家的意见，何建一等人漫不经心地表示接受医务处的处理结果。就在赵蕾满意地宣布散会时，张泠突然站了起来。
张泠质问赵蕾为什么不调查自己这个当事人，没有调查过自己这个处理结论自己就表示不服。赵蕾一时被噎住只好重新坐了下来。张泠陈述了当天和张梅发生矛盾的过程，整个过程里医护人员尽职尽责没有失误，全是张梅一个人在无理取闹。至于病人死后还有医嘱是因为他们当时急于抢救，只能在病人死后补上当时用药情况。张泠说的合情合理合规，赵蕾一时找不出破绽。这时赵蕾又问到，到底是谁改动了医嘱，此话一出众人鸦雀无声无人应答。