共20集
该剧将再现百年前蔡锷将军为反对袁世凯复辟称帝而发动“护国运动”的始末。电视剧将在尊重历史的前提下，为观众展现蔡锷将军在特定历史时期的风云传奇。《护国军魂传奇》讲述重九起义后蔡锷及家人被袁世凯“请”到京城，扣为人质，蔡锷在看清袁世凯真面目后， 破除重重困难，经日本，转台湾、香港地区，再过越南，最终返回云南反袁的故事。1911年10月30日，蔡锷在云南发动重九起义，响应武昌起义，大清朝终于在众多有识之士的努力下，落下了帷幕。重九起义两年之后，蔡锷被临时大总统袁世凯调到北京，多方势力角逐，危机始终围绕蔡锷。蔡锷为麻痹袁世凯，将自己扮成风流军人，并且结识了京城名妓小凤仙，在确认袁世凯一心称帝的真面目后，蔡锷下定决心反袁。在各方人士的协助下，蔡锷逃离北京，回到云南，发动了声讨袁世凯复辟的护国起义。
护国军司令部，蔡锷因考虑到郑森等将领虐待袁军俘虏一事，正奋笔起草“不妄杀、明纪律”的文告。
罗佩金进来报告纳溪人民支持护国战争的大量感人故事，蔡锷深为感动。
二人同时闲话历史人物曾国藩和洪秀全。
罗佩金深夜造访，蔡锷深知罗为人厚道，在昆明主政，政绩人人称道。
二人再次商量军机大事，直至深夜。
蔡锷召见朱德，商议攻打牛背石之事，二人说得很投机，朱对蔡的治军方略和为国为民一片苦心也深为敬佩。
蔡锷决定发起牛背石战斗，由朱德和董鸿铨两个支队参战。
蔡锷牵挂右路军重庆戴 戡的战斗情况而久久不见有消息，正在蔡锷焦急等待时，送来战报6份，蔡锷一口气读完，方知重庆方面战事进展情况，已经打过綦江，战报几次送出都被袁军截获，这次送来的人是作战参谋，经过千辛万苦送过来。