共34集
电视剧《暗算》分三部分，分别是《听风》、《看风》、《捕风》。每部十集，共三十集。三者相对独立，又千丝万缕。听风，即无线电侦听者；这是一群“靠耳朵打江山”的人，他们的耳朵可以听到天外之音，无声之音，秘密之音。看风，即密码破译的人；这是一群“善于神机妙算”的人，他们的慧眼可以识破天机，释读天书，看阅无字之书。捕风，即我党地下工作者；在国民党大肆实施白色恐怖时期，他们是牺牲者，更是战斗者，他们乔装打扮，深入虎穴，迎风而战，为缔造共和国立下了不朽的丰功伟业。第一部《听风》讲述的是安在天和瞎子阿炳的故事，第二部《看风》讲述的是安在天和天才数学家黄依依的爱情故事，第三部《捕风》讲述的是安在天父亲和母亲的故事。三部之间，故事本身没有什么连续性，人物的关系﹑故事的色彩和特质，包括讲述故事的热情和方式、风格等，都已时过境迁，今非昔比。但是从大的方面说，单位还是701，职业还是无线电侦察，敌人还是国民党特务，主人公还是安在天，故事的寓意还是天才改变世界，偶然决定一切。它们的联系就在这种若即若离中，藕断丝连中；在人物之外，在职业之中；在事件之外，在命运之中……而安在天的一生，写了中国革命历史中的一个灵魂……
安在天上海归来，意外地发现黄依依并没有离开701，相反她留了下来，并就任了破译处处长的职位。从徐院长口中得知，黄依依去后山农场接汪林的时候，发现汪林在她破译光密期间，又与邻村的一个寡妇好上了。她万念俱灰，得了一场大病。 安在天知道情况后非常难过，也许这个时候，他才意识到自己怎样伤害了黄依依。他主动找到她，带给她从上海捎回来的礼物，不料却遭到了黄依依的拒绝，她表明以后二人只能是同志和上下级的关系。 安在天失落了。 张国庆当街大哭，他把即将寄给家人的25块钱丢了，黄依依见状赶忙凑了25元钱给他，张国庆对此感激涕零。为人敦厚的张国庆不忘报恩，每日帮黄依依打水、洗衣服，黄依依对张国庆心存怜悯，时常接济他。张国庆从心底深处感激不尽，对黄依依照顾得更加周到。 黄依依找到安在天，请他帮助将张国庆的妻子调回701，安在天执拗不过，只好答应她。但他风闻刘丽华是个泼妇，担心有朝一日黄依依给自己招来麻烦。 果不其然三个月后，刘丽华来到食堂对黄依依破口大骂，指责她勾引张国庆，安在天冲上前喝斥张妻无理取闹，保护了黄依依。徐院长找黄依依谈心，想帮她解决个人问题，黄依依苦笑着回绝了。 小查陪黄依依一同来到县城医院看病，黄依依在厕所偶遇刘丽华。刘丽华拦住黄依依恶语相攻，黄依依靠在弹簧门边闭目不理，刘见状故意将弹簧门拉到最大，黄依依被弹簧门的惯力击倒，脑袋磕在下水道凸口，顿时不省人事。 黄依依颅内出血，经过抢救挽回了生命，但变成了植物人。面对失去意识和知觉的黄依依，安在天毅然决定将她接回自己家，悉心照顾她，盼望能够用爱将黄依依唤醒，但这个希望最终也没有实现，1965年3月9日，黄依依永远停止了心跳…… 安在天妻子小雨的死因是这样：安在天在某国边境执行任务的过程中，小雨一直忠实地做他的助手。然而，行动暴露，面对爱妻小雨和国家的利益，安在天做出了痛苦的选择——放弃小雨的生命，安在天深爱的妻子就这样倒在了自己的面前。