共36集
《神医喜来乐传奇》是继2003年播出的电视剧《神医喜来乐》成就经典的十年之后，原班主创再续前缘的新篇作品。由周振天担纲编剧、李保田领衔主演、柏杉升任导演。全剧延续前部故事和风格，情节更加跌宕起伏、角色形象更加丰满鲜活，并有全新人物登场。作品讲述了庚子年间，因得罪权贵被发配东北的神医喜来乐一家又被卷入时代的漩涡：喜来乐的死对头向洋人举荐其当军医；国难当头，宫廷内斗却依旧未曾停息……清末，沧州民间神医喜来乐因得罪朝廷权贵，被流放东北。时至庚子年八国联军入侵北京，喜来乐又被卷入时代的漩涡中。侵略者水土不服身染怪病，西医束手无策，喜来乐的死对头向洋鬼子举荐其当军医。但他不愿当汉奸，故而出逃以致身陷匪巢，却意外受到匪首之女金山娇的青睐。这个忠肝义胆女强人，给喜来乐的命运带来了巨大的改变，因为喜来乐，她闯皇城、入军营、劫法场，又随其到西安为太后和皇上治病。期间她与已成为喜来乐正室夫人的赛西施发生摩擦，最终由抵触到接受。国难当头，宫廷的内斗却并没有终止，喜来乐身处党争之中，左右为难。凭借精湛的医术和智慧，他在慈禧、光绪、袁世凯、侵略者面前最终坚持地活了下来。最后，侵略者撤军，太后和皇上先后辞世，袁世凯等军阀掀开中国战乱的序幕。喜来乐对大清国彻底厌烦和绝望，他带领全家再次避往关东。
金山娇来给太后请安，太后看她调教得不错，命金山娇白天陪皇上下棋，晚上回宫女的住处好好呆着。金山娇出了门，碰见了喜来乐和两个徒弟，就像不认识一样。后来金山娇还让德贵带着她的玉镯出宫，作为他与兰儿成亲的信物。金山娇来到了皇上的住处，皇上见了，又想起了珍妃，金山娇为了哄皇上开心，唱起了沧州小调。
太后请教喜来乐更好的扣肾治病方法，喜来乐给太后出主意，让她学着那些乡间老夫一样，去田间拾粪，这方法正好能够让太后反复的弯腰起身，不但强肾，还能舒缓心情。众臣自然是不愿意，拦着太后不让她去，太后找来了几个六七十岁的老妇，发现他们虽然年事已高，但个个都身体硬朗头发油黑，确信这拾粪是个好方法。
于是太后不顾众臣的反对，穿着农妇的衣裳，带着李公公来到了田间拾粪。一天下来，太后觉得身子骨舒服了许多，还怪喜来乐怎么不早把这么好的事情告诉她。第二天，又接着去拾粪，出门前遇见了带着金山娇出来散步的皇上，也都没顾着说话，直奔宫外。不料一些外国的记者暗中跟着他们，拍了照片，在一些国外报纸上刊登了出来，还有的传小道消息说皇太后已被贬为庶人，到田间干起了农活。秦太医带头怂恿，说这一切归根结底都是喜来乐惹的祸，应该将其千刀万剐，众臣也将罪过归结于喜来乐。太后气的下旨，要将喜来乐凌迟处死。