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大明正德四年,总捕头佟林,天涯寻妻来到古北口。他路见不平痛揍秦岭五虎,救下雕玉巧手麦玉芝父女、卖货郎燕三以及前往县衙上任的仵作刁五门。曾住悦来客栈的一名神秘女客失踪。佟林疑心是自己的妻子,四下寻找,发现她已变成无头女尸。知县胡原为女尸案开庭,京都锦衣卫葛天仪也来到悦来客栈,他对神秘女客很感兴趣,悬赏二百两找寻女客头颅,并四处打听一把精雕玉扇下落,引起海棠、玉芝的惊疑。原来,这把玉扇已由神秘女客抵押给了海棠,海棠请麦玉芝估价,玉芝将玉扇送去给她的雕玉老师贾盈烟估价,不料贾盈烟说此扇为不祥之物恐招杀身败家之祸。神秘的燕三终于吐露实情,他原来是为了搭救老上司总兵官赵无忌。赵无忌得罪当朝权贵刘瑾,被陷害流放关外,葛天仪受刘瑾密令截杀赵无忌,原来无头女尸是关外镇远将军上官志成的侄女,随身携带的玉扇,藏有刘瑾通敌卖国的铁证,所以葛天仪急于搜寻,燕三等人也在暗访,正邪势力齐聚古北口,都在等赵无忌囚车过关……《神捕》共分《北关喋血》、《碾玉观音》、《金面阎罗》、《双燕屠龙》四个部分,郑少秋、何晴等担纲主演。
石铸与佟林都怀疑潘媚娘的身份有假,便托麦青山以医治之名,试试她的脚是不是真瘸。林雁儿知道自己被怀疑,便设下苦肉计,要引出真正的金燕子。海大娘因救人心切,不听佟林劝阻,入牢劫狱,果真落入林雁儿的圈套,被朱厚彦逮捕。林雁儿陷害石铸入狱,石铸与海大娘在狱中,才知道海大娘的丈夫是石铸的恩人,遇难前他委托石铸带走女儿,不料女儿却被拐走不知去向。林雁儿为了钱,出卖待她如亲娘的海大娘。引起众怒。海大娘将被处决,林雁儿良心亦不安,佟林虽然身中剧毒,却也想出救出大娘的方法。