共43集
金鹏王朝，一个古老且被遗忘的国度，因陆小凤调查中原皇帝的怪病，再次进入到人们的视线中。遗族公主丹凤出现，为陆小凤指点迷津：只有金鹏王朝三名遗臣知道如何解开皇上身上的毒蛊，只要找到这三人，就能揪出阴谋幕后真凶。对王位有野心的诸王蠢蠢欲动，在皇宫中引起了斗争，他们搭团聚伙，陆小凤的处境越发艰难，调查亦不时陷入泥沼。调查过程中，陆小凤因缘际会与名医花满楼、剑圣西门吹雪结为好友；而一路跟着陆小凤参与调查的阿信，虽然深知陆小凤情归丹凤，但却发现陆小凤已经成为她无法放下的牵挂。陆小凤终于解开谜团，阻止真正的主谋卫王的谋反。陆小凤也失去了丹凤。悲伤过后，陆小凤蓦然回首，这才看见阿信始终在等待他。
孙秀清下山时遇到寻找上官丹凤的陆小凤与阿信，陆小凤知道她想与西门吹雪双宿双飞，他劝孙秀清考虑清楚，不要愧对于峨眉，孙秀清只好原路返回了峨眉。阿信利用天眼看到了上官丹凤被一群黑衣人带走，为首的是一个女杀手。
孙秀清的师姐拿了一封信下山给西门吹雪并让他尽快离开峨眉，西门吹雪看了一眼信就随手烧掉，表示自己不会离开。
峨眉登基大典如期举行，小童看此形势便劝西门吹雪赶紧回万梅山庄养伤，不要再等孙秀清了。孙秀清抱着掌门的衣服来到大殿，她将衣服交给任前辈随即便跪下磕了三个头，任前辈知道她去意已决，既然留不住她的心，留下她的人在峨眉也于事无补，任前辈放走了她。孙秀清下山去找西门吹雪，可他已经离开了庙里。
上官丹凤被带到青衣楼，少主让她说出金鹏王的下落，她不肯，少主便让人把她关在棺材里。少主将上官飞燕提拔为青衣楼楼主，他向上官飞燕表达爱意，上官飞燕以自己是个杀手不能有感情为由拒绝了少主。
花满楼不认同霍休的治病方法，他觉得表面上皇上的病情有了好转，实际上霍休反而在加快毒蛊的发作，花满楼把自己的想法告诉太后，太后反而指责花满楼不希望皇上尽快治好。
花满楼私下将皇上劫走，隔天太后发现找不到皇上后惊慌失措，不知如何是好，霍休找了个神情体态类似于皇上的人假扮皇上，但这只是缓兵之计，皇后让霍休私下尽快找到皇上。
卫王向皇后禀报皇上的病与峨眉派慧妙师太的病情一样，但慧妙师太是被独孤一鹤害死的，独孤一鹤没有加害于皇上，要想找出真凶还得依靠陆小凤才行。
花满楼带皇上到一处青山水秀的地方治病，他每天亲自为皇上熬药沐浴，皇上的病情逐渐有了好转。