共34集
贞元年间，因掌管人、妖两界的白泽神女意外身亡，白泽令不知所踪，妖兽在人间肆意流窜，作恶多端，且发生越来越多血腥凶案。此时已化为人形的百妖之首“朱厌”化名赵远舟（侯明昊 饰），主动“投诚”，提出协助朝廷组建缉妖司，缉妖平乱。文潇（陈都灵 饰）带着对赵远舟的防备与怀疑加入缉妖司，与青梅竹马的缉妖司领事、精通探案和剑术的卓翼宸（田嘉瑞 饰），曾是崇武营猎妖人的高冷弓箭手裴思婧（程潇 饰），精通医术善良且怂的神童大夫白玖（林子烨 饰）一道，组成了缉妖司捉妖小队，《山海经》中所记载的妖兽一一出现在众人面前。在破案过程中，众人逐渐发现妖兽作恶背后的残酷真相 。
卓翼宸被晕得颠三倒四时，傲因在涣灵散的作用下现出原形，天香阁很多人目睹了傲因显形的过程，都知道了文潇被栽赃陷害。英磊唤醒卓翼宸，继续一起追傲因，跑到院子里时，还是被傲因逃脱，好在有一点收获，帮文潇洗脱了嫌疑。
文潇被无罪释放，让卓翼宸急忙救裴思婧，好在裴思婧没有被温宗瑜威胁到，表示自己知道温宗瑜研究妖化人的秘密，和赵远舟已经把地牢里的见闻存储于日晷里，因此也随之被释放，裴思婧离开地牢后，卓翼宸拿出日晷，当着温宗瑜的面将其销毁。
眼下最要紧的事是修复白泽令，瑶水已经净化，但神木干枯，英磊忽然想到在灵犀山庄时，白玖曾不小心划破手掌复活了机柏木，拥有人神妖三族血统，或许也能复活神木。于是跑到郊外院落把血滴在树根上，神木长出一根绿枝，文潇表示修复白泽令需要三百年以上的树干，因此还是无济于事，赵远舟恐怕撑不过三天。
为了早日找到修复白泽令的方法，文潇挑灯夜读，卓翼宸听说文潇饭都顾不上吃，便炖了一碗银耳羹。看到文潇劳神费心的样子，即心疼又无奈。温宗瑜见缉妖司并不急着找赵远舟，猜测对方已经知道赵远舟藏身之所，便夜间吩咐手下给缉妖司制造压力，尽快找到赵远舟。
范瑛传达了崇武营的命令，卓翼宸只好执行抓捕赵远舟，文潇听说后苦苦哀求。赵远舟时时刻刻被戾气折磨，每次快要崩溃时就努力回忆和文潇在一起的时光，用人间温情一次次压制自己。
英磊酿了两坛酒请卓翼宸带给赵远舟，文潇每日沉浸在对赵远舟的担心忧虑中，白玖提到日晷，如果能把和赵远舟相处的时光放进日晷，就能随时回忆，文潇急忙向陆吾打听是否可以用日晷让时光暂停，带神木枝桠进入时空隧道，等到神木成熟时再修复白泽令，陆吾表示方法可行，但利用日晷暂停的时光度日如年，无比煎熬。
文潇拿出日晷，在昆仑门进行时光暂停，果然拿到了神木，准备出发修复白泽令时，英磊提到卓翼宸已经提前半天出发抓捕赵远舟，文潇表示不必担心，两人已提前商量好对策，卓翼宸说明白玖特制了一枚落魂针，可以使赵远舟进入假死状态，给向王一个交代，等过了风头再使赵远舟苏醒，白玖表示自己根本没研制过落魂针，英磊便推测卓翼宸有问题。
在天香阁抓傲因时，白玖的涣灵散明明已经减缓了速度，卓翼宸打头阵仍然让傲因逃脱，显然其中有猫腻，众人想想卓翼宸近来的表现，都觉得有道理。