共34集
贞元年间，因掌管人、妖两界的白泽神女意外身亡，白泽令不知所踪，妖兽在人间肆意流窜，作恶多端，且发生越来越多血腥凶案。此时已化为人形的百妖之首“朱厌”化名赵远舟（侯明昊 饰），主动“投诚”，提出协助朝廷组建缉妖司，缉妖平乱。文潇（陈都灵 饰）带着对赵远舟的防备与怀疑加入缉妖司，与青梅竹马的缉妖司领事、精通探案和剑术的卓翼宸（田嘉瑞 饰），曾是崇武营猎妖人的高冷弓箭手裴思婧（程潇 饰），精通医术善良且怂的神童大夫白玖（林子烨 饰）一道，组成了缉妖司捉妖小队，《山海经》中所记载的妖兽一一出现在众人面前。在破案过程中，众人逐渐发现妖兽作恶背后的残酷真相 。
附身于白玖形体的离仑进入地牢，发现到处是施了符咒的妖尸，胸口不禁一阵阵灼痛，温宗瑜料到离仑已经知道一切，出现在地牢后宣示自己的成就，随后用一个铁笼困住离仑，离仑表示自己永远不会受制于人，又化作一阵风逃出铁笼。
卓翼宸被诊断患了严重内伤，太医配制不出对症之药，只能以金汤吊着续命，赵远舟说明卓翼宸同云光剑共感共鸣，如果不能修复云光剑，任何人都救不了卓翼宸，当日大乱时云光剑被自己戾气所震慑才有了裂痕，否则单凭离仑无法将其击断。
英磊开始想念白玖，如果白玖在一起肯定能想到救卓翼宸的办法，忽然想起陆吾，昆仑山有很多奇珍异宝，必定会有救卓翼宸的办法，说着便喊上裴思婧通过山海寸境穿越到昆仑山，陆吾表示用云光剑对寄生原神进行剥离，可以治愈卓翼宸，但需要冰夷后人的配合。云光剑眼下被毁，根本发挥不了作用，陆吾又告知大荒有櫃木，可以使卓翼宸恢复真气，英磊便让裴思婧回天都陪文潇，自己决定到大荒冒险找櫃木。
离仑中了温宗瑜毒针后，身体愈发不适，但眼下最担心还是云光剑被修复，自己从白玖体内被剥离。甄枚在温宗瑜的悉心调理下完全康复，甚至比受伤之前还矫健，温宗瑜安排一定要想办法治愈卓翼宸，因为只有云光剑才能杀掉赵远舟。卓翼宸昏迷中梦到哥哥曾答应教授自己云光剑的剑法，但因为捕捉赵远舟被杀没能履行诺言，之后自己悟出云光剑的剑法，想到这里忽然睁开眼睛，喊了一句云光剑，片刻后又昏倒过去。
水池里忽然升起一块石头，赵远舟说明可能是五色石，缉妖司本来就是卓府宅院，卓家一定藏了五色石在最隐秘的地方，五色石可以修复万物，云光剑总算能复原了。众人正盯着五色石看着，离仑忽然出现，用树藤缠了五色石一下，却并没有夺走，等文潇拿着五色石走到卓翼宸身边时，五色石突然自动摔碎，赵远舟认为离仑刚刚出现并不是抢夺五色石，而是想把卓翼宸变成妖。五色石被树藤妖气侵蚀过，因此会自己摔碎。
英磊从大荒找到了櫃木，给卓翼宸服用后，能暂时续命，赵远舟却表示櫃木治标不治本，五色石破碎，是比云光剑损毁更大的灾难，五色石是镇压妖血的容器。冰夷实际上在远古时代也是妖，但因为斩杀应龙有功，女娲给了冰夷自由选择物种的机会，冰夷选择后人成为人类，最终用五色石封闭了冰夷一滴血，使后人仍能自由选择。
赵远舟分析离仑妖力进入卓翼宸体内，如果没有内丹根本无法承受强大的妖力游走，最坏的结局是五脏六腑爆裂而亡。谁都不愿意看到这样的结果，赵远舟想起或许可以去往冰夷族禁地，尝试找寻治愈卓翼宸的办法，但冰夷族禁地在大荒，条件极为恶劣，文潇表示不管多难都要亲自试一试。
甄枚到缉妖司偷听几人谈话，被发现后叮嘱英磊裴思婧好好照顾卓翼宸，使英磊感到吃惊，完全不像是甄枚会说的话。赵远舟见文潇对卓翼宸关爱有加，不由得称赞几句，文潇表示虽然是卓翼宸小姑姑，但两人一起长大自己受到卓翼宸照顾更多，尤其是在卓家父子出事后，卓翼宸没用多长时间便重新振作，自己看在眼里只觉得心疼。裴思恒现身陪裴思婧聊天，见裴思婧很担心白玖，猜测是从小照顾自己养成的习惯，好在自己终于不会再受伤，也能变成铠甲和姐姐一同作战。