该剧根据古籍《山海经》和民间故事改编而成,通过一个“花——如何生在人间”的美妙传说,将我国古代“女娲补天”、“后羿射日”、“夸父逐日”、“仓颉造字”、“神农尝百草”等上古神话和传说贯穿在一起,讲述了一个关于中华民族人文始祖盘古开天地后,人间部落因争斗产生瘟疫,为寻求战胜瘟疫的办法,玉帝之妹花神和神农(炎帝)经历千难万险,远走五岳天池,寻求净土真水,最终用天庭的种子让鲜花开满人间、解救人类苍生、人类自己能主宰自己命运的英雄故事。
无名人正是神农的父亲人王伏羲。神农知道了自己的身世以及伏羲和女娲的关系。伏羲坚持凡人可以自强自立掌握自己命运的观点,深深影响了神农。神农重拾信心,与花神汇合。众人前往中岳寻找最后一处净土。
大毛、二毛为报私仇,引蚩尤领兵围困太古城。危难时刻,红姑娘终于出手击退蚩尤。红姑娘拒绝了成为太古城城主的提议。
龙太子修炼有成,斩杀黑龙练成神兵黑龙剑,带领虾兵蟹将前往中岳。