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重庆解放前夕,叶大龙(连奕名 饰)带解放军小分队进入市邻执行秘密仼务。随着国军的溃逃,潜伏特务花名册的归属成了控制重庆地下网络的王牌。军统特务计雨棠(韩童生 饰)近来心神不定,缘自他在上司林南轩(钱勇夫 饰)的葬礼上,在棺材中发现了一双绣花鞋。山城重庆解放后,沈超(张潮 饰)当了公安局长,随军作战的林莹(孙俪 饰)爱上了骁勇善战的叶大龙,但不久叶发现林竟是国民党国防部二厅中将林南轩的女儿,心中很是纠结,并对原先在敌后工作过的沈超也产生了怀疑。其实林南轩的死是敌人抛放的烟幕弹,他躲在幕后导演,计雨棠等人在前台表演,叶大龙决心一定抓获这个危害新中国安全的特务组织......
计雨棠 决定南逃,却从斗鸡眼处知道了他们竟然有一枚炸弹藏在秦记鞋店里,计雨棠回头回到家里把那双拆得零落的绣花鞋带着,去墓地向妻子诉说着自己杀人的经历,他知道他已经暴露了自己,他是一定要离开的。 在公安局里,绣花鞋的电台信号再一次出现。计雨棠 在唐娃子的住处发现了正在发电报的他,唐娃子知道岳小青是自己杀的,他几乎每天都给台湾发电报,但是没有任何回音,跟踪而来的叶大龙等人把唐娃子带回了局里。唐娃子原来一直把电台零件背在身上,假装驼背。 电台被拆穿了,重庆市公安局破获了一件大事。然而电台里所说的绣花鞋行动到底是什么行动,却依然是个谜,局里决定让林南轩回到重庆,继续他的潜伏行动。因为叶大龙的工作不成熟,丁部长决定林南轩的潜伏工作不能让他参与。 唐娃子向沈强说出了自己所知道的一切,因为沈超的一支百合香烟让唐娃子相信他是自己的人。叶大龙再一次和沈超说出自己怀疑林南轩还活着,沈超转移话题,依然不肯将真相说出来。林莹主动要求参加成渝铁路的建设,她从林雯死的悲伤中走了出来。叶大龙无法和沈超真正沟通,只好将自己的猜测说与林莹。此时,林南轩从北京回到了重庆。