共30集
机密单位301研究所研发的新型深潜器在三岛市下水试验，实验过程连续遭遇泄密事件。三岛市国安局接到任务，60天内侦破此案。“坏小子”洪少秋和“女汉子”叶焓成立专案组，开始了跟敌人的博弈。办案过程屡屡遭遇意想不到的阻碍，洪少秋和叶焓也因彼此性格、做事方法的迥异而矛盾重重。专案组刚刚成立的第二天，就被D国“间谍王”比目鱼逼入绝境，断掉了一切线索。洪少秋把侦破视角转到了一个把他从小养大的地方——301研究所。在经过了情感与理智的搏斗之后，洪少秋终于抓出了内鬼，同时也收获了叶焓的信任。一个叶焓的“运用人”高一天意外出现，给整个侦破带来意想不到的转机，而就在一切都向着光明推进之际，终于发现了隐藏在最深处的“那双眼睛”。
洪少秋从刘子岸的的案件中猜测，商菲菲和刘进的密钥都被复制了，而张西洋的密钥估计也被复制了，证据就是张西洋在食堂吃了一顿却拉了一个星期的肚子，这给了犯罪嫌疑人足够的作案时间。而洪少秋通过多方面的推测，将目标锁在了蒋文锁身上。
江源跟着蒋文锁到处维修，最后江源被蒋文锁借口遗落工具支开了，蒋文锁不知道自己的一切行为都在洪少秋等人的监视下。他想动手解决了数据终端库的守卫人员，洪少秋发现及时，打电话支开了守卫人员。蒋文锁整个人显得异常紧张，在一切准备就绪之后，将三个密钥都插进了锁孔。申处长因为有洪少秋的吩咐，并没与安排人员进去查清情况，原是蒋文锁自以为安全的拿到了所有资料。
就在蒋文锁拷贝完所有资料，准备离开的时候，被洪少秋追上，蒋文锁明白他完了。蒋文锁没有争辩，将所有的事情，托盘而出。原来半年前，他在信箱里看到了一个没写名字的信封，里面是一张银行卡和一张字条，写着密码是你的出生月份。第二天，他就接到了一个自称是汤姆猫的人的电话，汤姆猫告诉他银行卡里有一百万。蒋文锁挂断电话，拿着银行卡到了银行查了一下，里面真的有一百万。蒋文锁心动了，汤姆猫说自己是来帮助他的，可以帮他儿子还清赌债，他妻子的医疗费，以及他小孙子上大学的钱，他知道无功不受禄，问对方要什么。对方表示是一些小事情，并且不会打扰蒋文锁的生活。蒋文锁就这样走上了不归路。
洪少秋从小在301的院子里长大，和这些人都有着浓厚的感情，所以得知蒋文锁是嫌疑人时，内心是拒绝的。蒋文锁其实也没帮他们做什么事，只不过拍拍船坞的照片已经会议记录。不过半个月前，汤姆猫来电话，他们要求蒋文锁复制张西洋的密钥。所以趁着所里开招待会，蒋文锁邀请张西洋吃自己亲自下厨做的饭菜，饭菜是被下了泻药的，没一会张西洋就去了卫生间，而他自己利用监控器拍下了保险柜的密码，从张西洋的公文包里拿到了密钥，并利用汤姆猫给自己的复制器复制了张西洋的密钥。就这样，蒋文锁犯下了第一件大错。
原本因为在食堂吃坏了肚子，张西洋肯定会和所里积极反应，但是张西洋知道，食品安全出了问题，蒋文锁一定会受到处罚，为了包庇他，张西洋选择了隐瞒。洪少秋等人经过蒋文锁的口供分析，得知蒋文锁会把拿到的所有数据放到一家超市的储物柜里，然后告诉对方柜号和密码，对方会安排人马来取。
洪少秋将计就计，让蒋文锁按照计划将硬盘放入超市的储物柜，然后在超市的各个路口以及电话亭都安排了相关人员。洪少秋想要放长线钓大鱼，所以他将硬盘交给了蒋文锁，并和叶晗保证一定会调到大鱼。蒋文锁将带有GPS定位系统的公文包和硬盘进入了超市，黄薇薇。也就是代号汤姆猫的神秘人打进电话，因为时间短暂，叶晗等人无法确定对方的位置。
米小冉让搭档大刘坚守岗位，而自己则溜进超市寻找可疑人员。米小冉在厕所遇见了蓝裙子女人，她今天穿了身白色裙子。米小冉跟在她身后，发现她取走了08货柜的硬盘，将带有GPS系统的公文包扔进了垃圾桶，接着她走进了女厕所。
米小冉紧随其后，却没有发现神秘女子的下落，洪少秋等人立马加强各个路口的人员排查，都没有相关的可疑人员。