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一九三八年,在抗日战争、国共合作背景下,蒋介石听信谗言授命西安特务组织,密裁第十八集团军高级参议、中共党员宣侠父,此举引发中共强烈抗议。迫于舆论压力,国民党被迫在西安成立破反专署,调查宣侠父失踪案。中共地下党员、原中统特工武仲明,成为国共双方共同认可的破反专员。武仲明领衔的破反专署,集结了西安军、警、特和八路军西安办事处各路人马,敌中有我,我中有敌,错综复杂,调查之旅甫一启程即步步陷阱、危机四伏!武仲明彻查宣侠父案两个月间,不仅是刀锋上的对决,也是人性的较量。在地下党组织引领下,正义同道前仆后继追寻下,武仲明终于查明真相,拿到了密裁宣侠父手谕。迫于证据确凿,蒋介石不得不向中共认账,自吞苦果!
为了寻找宣侠父的踪迹,武仲明和八办的人不惜在西郊乱坟岗进行掘地三尺,中统的人也混迹其中,他们是受了刘天章的命令来寻找小林的尸体,武仲明似乎察觉到了这些中统特工的诡异。而刘天章也没闲着,除了和徐亦觉一起调查菊剑外,他还在八办安插了内线,据他的内线报告,八办要将沈兰送往延安,刘天章觉得沈兰身份特殊,于是要想办法把沈兰给留在西安。
蒋敬文一回到西安,就听说了武仲明和八办进行全城搜寻宣侠父的下落,蒋敬文彻底动怒了,他把武仲明叫过去要求他立刻停止如此大规模的搜查行动,理由是耗费太多的人力物力。对于这个结果,八办当然不满,本来这次搜寻行动给予他们希望,但是现在在没有任何线索的情况下被迫要戛然而止,他们当然极度的不甘心,可这个时候武仲明只能听从蒋敬文的安排。这段时间,武仲明对八办态度暧昧,徐亦觉已经不止一次提醒武仲明和八办保持距离,而武仲明总是一笑置之。
这次的搜寻行动,警察局也有所参与,因此杭局长也被蒋敬文训斥了一顿,杭局长对武仲明怀不满,因此拒绝了再让武仲明借用他的人,可师应山除外,武仲明就是一直拽着师应山不放,就算师应山不想趟这浑水,打了退堂鼓。其实这次的搜寻行动,找人并非武仲明的真正目的,武仲明是想利用这次机会看看各方的反应,很明显,中统的反应最大,显然宣侠父失踪和他们一定有着关系。但是武仲明不打算现在就跟刘天章摊牌,因为武仲明还是想确保宣侠父的安全。
蒋宝珍主动找到了刘天章,想要让他把自己弄进破反专署,刘天章没有同意,因为他知道作为特工需要见识足够的残忍,于是刘天章把蒋宝珍带到了监狱里,让她看如何行刑。受刑的是那个哑巴,刘天章用电刑折磨他,哑巴甚至开始失禁。这一幕让蒋宝珍终于无法忍受了,跑出了刑讯室狂吐,这个时候武仲明闻讯赶来,二话不说,直接让人把蒋宝珍送走了。
再次被武仲明赶出破反专署,蒋宝珍非常生气,于是回到家后她把气撒到了她非常讨厌的白牡丹身上,蒋敬文是安抚了好久才把白牡丹哄开心了。谁人都知蒋宝珍想进破反专署,于是徐亦觉便跑过来给蒋敬文出起了主意,出于武仲明只身的身体状况考虑,让蒋宝珍作为保健医生进入破反专署,这个理由足够名正言顺。蒋敬文思虑再三后终于答应了遂了蒋宝珍的心愿同意她进破反专署,得知这个消息,蒋宝珍十分开心,但蒋敬文一再嘱咐蒋宝珍一定不要对武仲明产生感情。
蒋宝珍以军医的身份正式进入了破反专署,当武仲明知道后当即提出了强烈反应,但是当蒋宝珍拿出了武仲明当年在军统的病历,武仲明顿时哑口无言。原来当年因为医疗手段有限,武仲明脑袋中的子弹并未被完全取出,因此蒋宝珍如此拿这个做文章的话,武仲明很有可能也得离开破反专署,无奈之下,武仲明只好同意了蒋宝珍留下。