共32集
《孤军英雄》主要讲述的是1942年，江南新四军与旧、日伪进行着残酷的战斗，国民党军队环伺左右。国民党将军郝俊杰（李雪健 饰）预料到数年后国 共必有一战，便策划实施了借用一支向新四军投诚的汪伪部队，从内部一举打垮江南新四军的“金太阳计划”。即设法指使汪伪部队的独立团投诚新四军，再利用潜伏的卧底挑起内战，并最终利用日本人的力量一举消灭新四军。剧中主人公车道宽(胡军饰演)作为新四军的基层指挥员，为了获取金阳计划的内幕，挖出特务，孤军一人在日军、伪、国中间周旋。他出奇制胜、不惧牺牲，与战友们一起彻底粉碎了敌人的阴谋。当这个设计周密、异常凶险的危机袭来的时候，新四军指挥员车道宽（胡军 饰）以超乎常人的警觉性和果敢的行动，一步步识破了敌人的阴谋，最终带领战友们杀出血路，在千钧一发之际改变了战场格局并获得了胜利。该剧剧情悬念不断，高潮戏纷至沓来。七十余个剧中角色皆有实力演员担纲出演。
炸弹的盒盖连着起爆器，一开就爆。方昭武接到晃猛的电话，一团防区内发现左玉琨的踪迹，左玉琨逃入山里，还开枪打死了几名民兵，方昭武命他们进山搜索。金医生想谋杀郝俊杰时被发现，赵将军将他带走后严刑拷打，金医生没有交待，郝俊杰提出单独和他聊聊，他这样的经历还是头一回，金医生强忍着，郝俊杰说出了金阳计划，金医生很想知道内容，他的行动付出了代价，郝俊杰不明白他的做法。
郝俊杰要公审金医生后处决他，他很爱惜车道宽的才干。车道宽在路上让司机停下，司机想要开枪时被车道宽开枪打死，车道宽下车后听到车里的定时炸弹走动的声音，日军在约定时间内没见到车辆后撤退。车道宽在安全地点看到日军飞机朝大路投弹，日军搜查汽车时发生爆炸，池田十分愤怒。国军搜索队发现车内死了一个，车外四个，没有找到上校军衔和那块怀表。
池田带人继续搜索车道宽，车道宽在林中奔跑。左玉琨被民兵追赶，他的枪声将日军和民兵吸引过去，当左玉琨摔了跟头后被日军俘获。方昭武还怀疑左玉琨是日军派来的，小林对左玉琨进行审问，他交待了自己的身份，他准备地说出新四军一团、二团和独立团的准确位置，还知道了静水县当时的兵力状况，小林指骂本多就是笨蛋。车道宽逃跑途中发现民兵，可他们不相信他是新四军，车道宽只好绕道而走，但还是被当成J细追赶。
刘一江见到左玉琨，左玉琨再三解释，刘一江也是看在小林的面上才没杀他，左玉琨想利用刘一江实现金阳计划，可刘一江还是不敢相信他。方昭武收到民兵来报的消息，他命人不允开枪，车道宽躲在林子里见到有人骑马去司令部，他在半路故意设伏将他们打下马来，骑马的三名新四军被绑起来，车道宽扮作新四军将领去了司令部，白晓玲洗衣服时看到了车道宽的背景，她高喊时车道宽没听到。车道宽的归来让方昭武十分欣喜，战士们也异常兴奋，方昭武难以掩饰自己的喜悦，他高兴地流出泪水。
国军没有搜索到车道宽，郝俊杰并不担心金阳计划。车道宽向昭武汇报了静水县战况，两人研究起潜伏特务，独立团让他们不敢整编和使用。方昭武让车道宽回独立团把卧底查清，他有些后悔没有把左玉琨关押起来。方昭武向车道宽说起白晓玲的付出，而车道宽也不想对于晨露食言，在他心里一直把白晓玲当妹妹看，他不想让她再遇到危险，还建议让白晓玲不要再担任发报任务。方昭武看到车道宽抢的文件袋后知道他抢的是新派来的政委，车道宽也是迫不得已。