共32集
《孤军英雄》主要讲述的是1942年，江南新四军与旧、日伪进行着残酷的战斗，国民党军队环伺左右。国民党将军郝俊杰（李雪健 饰）预料到数年后国 共必有一战，便策划实施了借用一支向新四军投诚的汪伪部队，从内部一举打垮江南新四军的“金太阳计划”。即设法指使汪伪部队的独立团投诚新四军，再利用潜伏的卧底挑起内战，并最终利用日本人的力量一举消灭新四军。剧中主人公车道宽(胡军饰演)作为新四军的基层指挥员，为了获取金阳计划的内幕，挖出特务，孤军一人在日军、伪、国中间周旋。他出奇制胜、不惧牺牲，与战友们一起彻底粉碎了敌人的阴谋。当这个设计周密、异常凶险的危机袭来的时候，新四军指挥员车道宽（胡军 饰）以超乎常人的警觉性和果敢的行动，一步步识破了敌人的阴谋，最终带领战友们杀出血路，在千钧一发之际改变了战场格局并获得了胜利。该剧剧情悬念不断，高潮戏纷至沓来。七十余个剧中角色皆有实力演员担纲出演。
于晨露的行动都被躲在暗处潜伏两年的车道宽看在眼里，她派的人被车道宽杀死。刘勋德命六师从新四军和日这中间区域撤出，他们准备实施金阳计划的最后一部分。方昭武从延安回到根据地，他向晁猛详细得了解车道宽被枪决的整个过程，方昭武指责他的窝囊做法，收到司令部急电后和晁猛研究军事部队。中央军整修通往新四军的道路，撤出了新四军与日军之间的部队，其他主力部队也已经做好了围攻之势。一场大仗迫在眉睫。
绸缎庄的大伙计被车道宽打晕后绑起来，他的身份被识破，在车道宽的逼迫下他只好交待金阳计划已经开始实施，车道宽连夜赶往新四军驻地，阻止老孙向饭里投毒，如果根据地的首脑失去作用，新四军将陷入绝境。郝俊杰想把伪七师的易帜搞的大一些，他们想挑起内战。车道宽赶到新四军驻地后向老孙问起那包药，还把他绑起来后打晕。
于晨露的任务完成了，郝俊杰已经给她安排好去美国的手续。车道宽扮作伙夫老孙在新四军驻地行动，新四军战士发现老孙被人绑住，他身上写着卧底的投毒的字样。曾逞与葛存金敏锐地感觉到来自车道宽的威胁，车道宽在暗处看到他们在行动，白晓玲见到车道宽后很高兴，郭世文对她很好，他让她告诉郭世文说曾逞与葛存金都是卧底。张成良看着老孙身上的字也判断是车道宽干的，车道宽的出现给曾逞一个机会，曾逞想提前执行金阳计划。
伪7师枪杀独立团伤员，独立团人心不稳。曾逞对张成良谎称与晁猛的主力一旅联络不上，焦急的张成良派曾逞火速赶回独立团控制局面。在郝俊杰的授意下，霍将军命令伪7师一部，伏击了独立团的伤员，残忍地杀害了三十几名伤兵。刘勋德派记者和赵将军赶往金阳接受伪七师，小林意识到霍将军投向中央军一方，日晕也陷入困境。电报在第一时间，通过一旅的电台送达张成良。坐在司令部里的张成良，猛然醒悟：7师枪杀伤员，曾逞怎么会提前知道?中央军大兵压境，侦查连为何不报告?所有的这一切，只有一个解释：曾逞与葛存金正是他们要找的卧底。
郭世文被紧急派往独立团，白晓玲给他送行，她已有孕在身。张成良命警卫连去抓葛存金回来，他向一团发报说明情况。方昭武识破了郝俊杰的金阳计划，他清楚金阳是准备死路，那条通道成为关键，方昭武命部队赶往冯家峪修筑军事工事。车道宽在路上也感觉到那条通道的重要性。通过电台的广播，方昭武得知7师已经易帜，投奔了中央军，他让晁猛派骑兵抢占凌波桥。