共32集
《孤军英雄》主要讲述的是1942年，江南新四军与旧、日伪进行着残酷的战斗，国民党军队环伺左右。国民党将军郝俊杰（李雪健 饰）预料到数年后国 共必有一战，便策划实施了借用一支向新四军投诚的汪伪部队，从内部一举打垮江南新四军的“金太阳计划”。即设法指使汪伪部队的独立团投诚新四军，再利用潜伏的卧底挑起内战，并最终利用日本人的力量一举消灭新四军。剧中主人公车道宽(胡军饰演)作为新四军的基层指挥员，为了获取金阳计划的内幕，挖出特务，孤军一人在日军、伪、国中间周旋。他出奇制胜、不惧牺牲，与战友们一起彻底粉碎了敌人的阴谋。当这个设计周密、异常凶险的危机袭来的时候，新四军指挥员车道宽（胡军 饰）以超乎常人的警觉性和果敢的行动，一步步识破了敌人的阴谋，最终带领战友们杀出血路，在千钧一发之际改变了战场格局并获得了胜利。该剧剧情悬念不断，高潮戏纷至沓来。七十余个剧中角色皆有实力演员担纲出演。
刘勋德相信车道宽不敢追杀他，郝俊杰恨他自己瘫痪的两条腿，他同意转往重庆。车道宽换作国军服装来到医院，到医院后才听护士说起郝俊杰去了重庆，郝俊杰选择了退却，这让车道宽失去了目标，他只好回去监视葛存金。车道宽秘密潜回新四军驻地，他在夜里见到郭世文，郭世文无法调出葛存金，他还说起张成良天天逼着白晓玲与自己结婚，车道宽让他帮忙约出白晓玲，车道宽的出现让白晓玲十分吃惊，她紧紧地抱住他。
车道宽向白晓玲说明了郭世文当时的做法，郭世文那样做也是为了白晓玲，白晓玲答应车道宽会好好地活下去，她和郭世文结婚了。两年后的1945年5月，法西斯德国宣布无条件投降，欧洲战场的战事结束，金阳计划也已经进入到了最后的实施阶段。郝俊杰从重庆归来，他看到刘勋德制订的计划，他们想通过金阳计划来引起内战，郝俊杰最痛心的是左玉琨的死，他准备亲自涉险收服霍将军这条滑泥鳅，郝俊杰带着于晨露来见霍将军，希望他能审时度势，纳上投名状，归顺中央军。
霍将军听完郝俊杰的话后被收服了，还发出联名信给中央军发去，71师的团营长都是郝俊杰的部下，他半年前曾联系他们。曾逞向张成良汇报中央军的动向，张成良命部队重新部署，曾逞建议转移后方部队。霍将军将他写的信交到于晨露手上，他还是不愿意在信上按手印，在于晨露的坚持下他同意了。
郝俊杰痛失家人是因为战乱，他制定金阳计划是为了尽早结束战争，还想让于晨露去美国生活。张成良命非战斗人员马上转移，曾逞的建议让他言听计从。郝俊杰让人将车道宽和于晨露的结婚照片在报纸上传扬，赵部长看到后把报纸拿给张成良，曾逞进来后也看到报纸。郝俊杰看着墙上的照片向于晨露说起那些人的经历，那些人和她父亲都有千丝万缕的关系，他让她以后见到他们以后一定要磕头。
郭世文被张成良叫到指挥部，他看到报纸上的照片后承认车道宽是他放走的，郭世文不相信车道宽会做出报纸上的事情，他知道车道宽在查金阳计划，张成良将郭世文的全部职务撤消，还让曾逞回去指挥独立团。在静水县的绸缎庄，于晨露秘密召见了独立团的卧底葛存金和伙夫老孙，通知他们金阳计划正式启动，于晨露将药交给老孙，她想拉回独立团，老孙犹豫了，他不想让新四军首长们受到伤害。