共34集
故事发生在抗日战争期间，日军决定实施代号“1855”的行动，企图将细菌武器应用到战场，我方情报工作人员启动“代号夜来香”行动还击，粉碎了日军的阴谋。该剧由陈燕民导演，许晴、董勇主演。一九三九年，北平。占领北平已经两年的日本鬼子此时正在筹划一项罪恶阴谋，启动代号为“1855”的行动计划，企图在北平建立一个秘密的细菌武器试验基地，把罪恶的细菌战由东北扩展到华北，由北平推向全中国。道高一尺，魔高一丈。中共北平地下党组织针对日本鬼子的罪恶计划，立即启动了代号为“夜来香”的行动计划，揭露，阻止，赵依娜是‘代号夜来香’行动的核心人物。她潜伏到日军的特高课，并争取到细菌研究专家三井的信任，成功进行了策反。粉碎日本鬼子的阴谋。在众多谍战剧中有自己的特色，我希望该剧以人物的设置和悬念迭起的故事吸引观众。选取了中国古代 ‘三十六计’中的很多计谋融入剧情中，突出我方情报人员的大智大勇。《谍变1939》原名《代号夜来香》。
赵依娜把帮助三岛翻译的文件交给三岛，三岛非常满意。这时丸子不期而至，见三岛手拿文件，对赵依娜却毫不回避。丸子把赵依娜支开，质问三岛为什么不回避赵依娜，三岛直言赵依娜不是外人。丸子非常恼火。三岛请丸子转告特高课，他希望另选一个人来接替他的工作，他对他从事的研究已经十分厌恶。丸子指斥三岛在当逃兵。二人不欢而散。
沙丽悄悄来到沈啸飞的情报站，沈啸飞手把手地教沙丽如何打开三岛书房里的保险柜。
沙丽回到三岛公馆，对三岛说自己房间里的抽屉钥匙找不到了。三岛拿出一大串公馆里的备用钥匙交给沙丽，让她自己去试。
那串钥匙放到了沈啸飞的桌上。经尚良辩认，找出了保险柜的备用钥匙。
丸子把三岛的厌战情绪报告给了松井。松井却不以为然。
夏连长找到一个以前认识朱大嫂的村民对雅枝子悄悄进行辨认，村民肯定地说眼前的这个人根本不是朱大嫂。夏连长立即命令抓捕。许马急忙制止，说可以充分利用一下这个难得的机会，再给鬼子一次沉重打击。
康力主动接触雅枝子，告诉雅枝子游击队已经决定转移，让她考虑自己的去处。雅枝子显得非常有性格，她固执地表示，不管游击队转移到哪里，她都会跟战士们在一起，决不离开。
夏连长集合全队，宣布明天一早全队转移。转移的时间路线地点都向战士们说得一清二楚。雅枝子在一旁的柴房里，也听得一清二楚。
入夜，雅枝子又开始发报。许马接到报告，与夏连长孙指导员相互会意。
松井接到了雅枝子的密电，立即命令小野率部队出动。
丸子突然来到三岛公馆里，宣布今夜有重大行动，所有人不准离开自己的房间一步。她坐在客厅里，密切注视着赵依娜和沙丽的一举一动。
沙丽悄悄来到赵依娜房间，她不知道如何应对看守住三岛公馆的丸子。赵依娜把将要发生的一切给沙丽编了一个故事，沙丽听后连说过瘾。
清晨，雅枝子突然发现游击队营地里只剩下她一个人，所有人都不知去向。她发现情况不对，急奔进柴房拿出发报机。许马悄悄出现在她身后，用日语叫了一声她的名字。雅枝子下意识反应，再想稳住神态，为时已晚。许马告诉她，她已经彻底暴露了。雅枝子猛地从枕下掏出手枪，朝自己太阳穴扣动了扳机，枪却没响。许马伸出手，手心里有六颗金黄的子弹。
许马告诉雅枝子，她发出的密电一定会让松井兴奋，而游击队现在的位置，正是日兵的必经之路。雅枝子简直要发疯了。
土肥原走进松井的办公室，告诉松井，部队进了游击队设下的圈套，损失了整整两个小队，偷鸡不成倒蚀了一大把米。松井无地自容。
夏连长和孙指导员得胜而归，全队个个兴奋。许马告诉大家，他决定放雅枝子生还，对以后的事情会更有利。夏连长托许马转告，希望组织上立即派一名报务员来，游击队有了电台，就会如虎添翼。
雅枝子回到特高课，松井把土肥原对自己的训斥全部转给了雅枝子。雅枝子提出戴罪立功，松井却将她送进了调查部。丸子提醒松井，必须对雅枝子网开一面，不然会影响到三岛的情绪。
雅枝子被调查部释放回家，三岛百感交集。
许马康力回到北平，大家一起庆祝取得的胜利。庞书记同意派报务员到游击队去，并且告诉大家，早就蜇伏在北平城里的电台“蓝站”就此启用。