共34集
故事发生在抗日战争期间，日军决定实施代号“1855”的行动，企图将细菌武器应用到战场，我方情报工作人员启动“代号夜来香”行动还击，粉碎了日军的阴谋。该剧由陈燕民导演，许晴、董勇主演。一九三九年，北平。占领北平已经两年的日本鬼子此时正在筹划一项罪恶阴谋，启动代号为“1855”的行动计划，企图在北平建立一个秘密的细菌武器试验基地，把罪恶的细菌战由东北扩展到华北，由北平推向全中国。道高一尺，魔高一丈。中共北平地下党组织针对日本鬼子的罪恶计划，立即启动了代号为“夜来香”的行动计划，揭露，阻止，赵依娜是‘代号夜来香’行动的核心人物。她潜伏到日军的特高课，并争取到细菌研究专家三井的信任，成功进行了策反。粉碎日本鬼子的阴谋。在众多谍战剧中有自己的特色，我希望该剧以人物的设置和悬念迭起的故事吸引观众。选取了中国古代 ‘三十六计’中的很多计谋融入剧情中，突出我方情报人员的大智大勇。《谍变1939》原名《代号夜来香》。
土肥原发现自己精心营建的特务组织里，竟有那么多坚定的抗日分子，这令他感到异常失落。他情绪烦躁，十分不冷静地下令，立即强行推进1855。
土肥原命令丸子再见三岛，敦促他不要再坚持抵触态度。
丸子见到三岛，转达了土肥原的命令。三岛告诉丸子，他只有两个条件，见到良子，知道妹妹雅枝子的真实下落。
丸子报告给土肥原。土肥原大怒，说三岛没资格跟他讲任何条件。但他突然想到，三岛敢于提出条件，就说明他已经有了解决技术难题的办法和措施，不然以三岛其人，是不会谈条件的。他命令丸子，给三岛最后通牒，交出核心机密，不然是自寻死路。
松井走进了柳田的办公室。柳田告诉松井，自己已经向总部申请，再派一个专家来顶替三岛。而松井却认为，与其无休止地指望一个所谓专家，不如靠自己来解决问题。他认为之所以要推行1855，不光是因为它具有无比巨大的杀伤力，更重要的，是它具有无比巨大的威慑力，这种威慑力能使敌人闻风丧胆，能够彻底摧毁敌人的意志，这在战争中是无比重要的。所以，在目前的情况下，他认为必须强制推行1855计划，即使蒙受巨大的牺牲，也在所不惜。柳田立即响应，这两个曾经唇枪舌剑的人突然表现出惊人的一致。
土肥原命令丸子，密切注意赵依娜的一举一动，一定要通过赵依娜，把三岛的核心机密从三岛公馆里挖出来。他命令包围三岛公馆，直到获得机密为止。
三岛公馆被一大群日兵包围起来，不准任何人出入。
赵依娜觉着冷静地面对这一突如其来的紧急情况。
地下党员们替赵依娜担心，马超提出立即给游击队发报，调游击队进城，把赵依娜从敌人手里营救出来。许马制止了同志们的冲动，他已经有了成熟的计划。
赵依娜悄悄收拾好了良子的行装，让良子去找秀子，以做夜宵为由，把秀子支进了厨房。紧接着，她拉着良子的小手，从三岛离开前交待给她的秘密通道，安然离开了三岛公馆。
当秀子端着一碗热气腾腾的面条来到良子房间时，才发现良子和赵依娜早已不知去向。
柳田致电土肥原，让他看自己的调防报告。土肥原知道柳田是在用这样的方式羞辱自己的无能，但却没有任何强硬理由回击对方。柳田告诉土肥原，他将向最高军事法庭提出控告。
土肥原恼羞成怒地下令，立即查抄三岛公馆。
丸子小野率众闯进三岛公馆，公馆里只剩下秀子一个人。
赵依娜带着良子来到城北站，把良子交给了雅枝子。
敌人的阴谋一个个被挫败，赵依娜和许马的感情也一步步深入。二人向组织上郑重提出了结婚的请求。庞贺年代表党组织同意了二人的请求，赵依娜进而提出，今后由她和许马来把李本真刘玉兰同志的儿子小宝抚养成人。庞贺年表示要亲自作二人的证婚人。赵依娜代表许马向组织上表示，她们二人的婚礼，要等到彻底摧毁了敌人的1855计划之后再举行。