共34集
故事发生在抗日战争期间，日军决定实施代号“1855”的行动，企图将细菌武器应用到战场，我方情报工作人员启动“代号夜来香”行动还击，粉碎了日军的阴谋。该剧由陈燕民导演，许晴、董勇主演。一九三九年，北平。占领北平已经两年的日本鬼子此时正在筹划一项罪恶阴谋，启动代号为“1855”的行动计划，企图在北平建立一个秘密的细菌武器试验基地，把罪恶的细菌战由东北扩展到华北，由北平推向全中国。道高一尺，魔高一丈。中共北平地下党组织针对日本鬼子的罪恶计划，立即启动了代号为“夜来香”的行动计划，揭露，阻止，赵依娜是‘代号夜来香’行动的核心人物。她潜伏到日军的特高课，并争取到细菌研究专家三井的信任，成功进行了策反。粉碎日本鬼子的阴谋。在众多谍战剧中有自己的特色，我希望该剧以人物的设置和悬念迭起的故事吸引观众。选取了中国古代 ‘三十六计’中的很多计谋融入剧情中，突出我方情报人员的大智大勇。《谍变1939》原名《代号夜来香》。
席间，黎世昌向佐藤云子频送殷勤。突然一人冲进包房，说声走错门后立即离开。众人正在疑惑，由尚良周海生装扮的一队日本宪兵冲进，责问众人把刚刚跑进的共党特工藏到什么地方去了。众宪兵不管众人如何解释，全部拘押。佐藤云子大怒，黎世昌劝她不要吃眼前亏，先跟这些人走，然后通知特高课接人。
在一所库房里，黎世昌许马刘春同拘一室。宪兵出现，对几人身份一一审核，逐个释放。黎世昌惊问佐藤云子下落，宪兵说还在审查之中。
李茹萍在三岛公馆里反客为主，要与三岛谈话。三岛只好应承。李茹萍问三岛知道不知道他妹妹雅枝子是怎么死的，她告诉三岛，雅枝子是死于中共特工之手，之后就指责三岛是个懦夫，他应该打起精神去战斗，要向中共特工报仇。
黎世昌许马刘春坐在特高课行动队屋里，丸子问他们佐藤云子下落，三人齐说不知。小野前来报告，说经过调查，那些宪兵肯定是假扮的。丸子命令黎世昌立即带侦缉队全体出动，一定要把那些假宪兵抓捕归案，救回佐藤云子。
出了特高课，许马提醒黎世昌不要陷得太深，黎世昌表示接着对付。
昏暗的仓库里，蒙着双眼的佐藤云子喊得嗓子都哑了。赵依娜平静地坐到她面前。她对佐藤云子说，蓝站失控，损失日谍，佐藤云子必须承担责任，另外，皇军的人质被她悄悄保护起来，这一切都是要追究的。佐藤云子中计，大喊着可以带众宪兵去一个地方，把孩子交到特高课，以洗清自己的罪名。
黎世昌知道要想彻底摆脱干系，只有找回佐藤云子。许马说他有办法。黎世昌让许马全权负责。许马把侦缉队的人手作了安排，自己带着会骑摩托车的刘春。
在郊外的一处秘密据点门外，佐藤云子被押下了车。虎子出现，佐藤云子敏感地发现她面前的这些人根本不是日本宪兵。她让虎子开枪，再也不肯前进一步。赵依娜来到佐藤云子面前，告诉她，她就是死了，在特高课眼里，也是被宪兵当做共党嫌犯处决的，她只有服从，把孩子交出来，才会获得生的权利，才有可能洗刷自己的罪名。佐藤云子知道别无选择，只好带众人进了据点。
小宝出现了，飞奔到赵依娜面前，赵依娜百感交集地把小宝抱在怀里。
据点里的日兵冲出，一场混乱在即。佐藤云子狂喊起来，命令据点里的日兵打电话报告特高课。虎子轻挥铁拳，佐藤云子顿时昏厥过去。
许马突然出现，刘春驾驶着摩托车冲进人群，许马抱起佐藤云子上了摩托车，飞速离去。赵依娜把一切看在眼里，深深佩服许马的机智。
丸子接报，立即命令全队出动，但为时已晚。
许马回到警局，黎世昌大喜过望，要为许马庆功。许马立即说刘春也是功不可没，刘春大振，表示至死跟定了许马，愿为许马赴汤蹈火。
地下党员们设灵堂祭奠李本真刘玉兰夫妇的英灵。他们的儿子小宝满含热泪，向父母敬叩。庞书记表彰了赵依娜和许马的勇敢机智。但赵依娜与佐藤云子发生过下面接触一事，令庞书记甚为担心。许马闻听佐藤云子肯定能认出赵依娜，立即说由他来想办法，让佐藤云子立即消失。