共34集
故事发生在抗日战争期间，日军决定实施代号“1855”的行动，企图将细菌武器应用到战场，我方情报工作人员启动“代号夜来香”行动还击，粉碎了日军的阴谋。该剧由陈燕民导演，许晴、董勇主演。一九三九年，北平。占领北平已经两年的日本鬼子此时正在筹划一项罪恶阴谋，启动代号为“1855”的行动计划，企图在北平建立一个秘密的细菌武器试验基地，把罪恶的细菌战由东北扩展到华北，由北平推向全中国。道高一尺，魔高一丈。中共北平地下党组织针对日本鬼子的罪恶计划，立即启动了代号为“夜来香”的行动计划，揭露，阻止，赵依娜是‘代号夜来香’行动的核心人物。她潜伏到日军的特高课，并争取到细菌研究专家三井的信任，成功进行了策反。粉碎日本鬼子的阴谋。在众多谍战剧中有自己的特色，我希望该剧以人物的设置和悬念迭起的故事吸引观众。选取了中国古代 ‘三十六计’中的很多计谋融入剧情中，突出我方情报人员的大智大勇。《谍变1939》原名《代号夜来香》。
刘春醒来，发现自己和许马被分别捆在两棵大树上。刘春说万万想不到，佐藤云子居然是共党的人。许马却让他赶紧磨身上的绳子，逃命要紧。
许马刘春回到警局，刘春学舌，复述康力的话。丸子听说佐藤云子被共产党游击队接走，大惊失色。
丸子向土肥原报告佐藤云子的下落，土肥原顿时失态，立感蒙受奇耻大辱。他命令丸子严审许马和刘春，宁肯嫁祸二人，也要洗刷这次耻辱。
许马刘春被带进特高课审讯室，丸子大有欲加之罪的意思。许马沉着冷静，说丸子是想灭口，是在我们帮了游击队一个大忙之后，又帮了游击队一个更大的忙吗。一席话出口，说得丸子哑口无言。
基地长官柳田走进特高课，对丸子治下的北平特高课毫无建树大加讥讽。柳田让丸子转告土肥原，如果他们继续这样无能，他就会请求最高长官，由他来取代特高课，完成特高课无力完成的事情。
周海生仍在严密监视郭忠杰，再次发现了松井的行踪。而特高课派出的日谍也看到了同一情况。
土肥原也遭到了柳田的质问，他命令丸子，把三岛调到基地里去，让脾气不好的柳田来约束三岛。
丸子来到三岛公馆向三岛传达了土肥原的命令，调三岛进基地，由李茹萍继续教良子。三岛坚持留下赵依娜，否则就不执行这项命令。丸子打电话给土肥原请示，土肥原只好让步，命令赵和李都留下。
三岛打点行装，请赵依娜到书房。他告诉赵依娜，他最终选择了正义，向她交待了以后的事情，包括机密文件的去处，万一遇到危机情况如何通过秘密通道逃离公馆，等等。赵依娜深受感动。她知道三岛此去凶多吉少，二人依依告别。
赵依娜向组织上汇报了敌人的新动向，经过分析，她认为鬼子下一步是要逼着中国人作人工布洒器的使用者，以避免出现两败俱伤的局面。大家的思路一下清晰了，联系到之前松井与三十九军之间发生的事情，分析出鬼子的行动目标，是企图策反这支部队，让他们作1855计划的具体执行者。三十九军军长孙成，在大家眼里突现了。
土肥原问丸子下一步的打算，丸子说策反孙成之事，还没想好从何入手。土肥原告诉她，孙成其人既是孝子，又是慈父。丸子茅塞顿开。
丸子把黎世昌召到特高课，命令他立即启用宾归客栈，派出特别勤务。黎世昌追问什么人能享受特别勤务，丸子告诉他，要侦缉队严密看管好的人，是三十九军军长孙成的母亲和女儿。
黎世昌告诉许马客栈特勤的内容，把此事派给了许马。
许马立即向组织上汇报，众人形成决议，创造机会接近这一老一小，让她们知道自己眼前的处境，为粉碎敌人的策反阴谋打开一个突破口。
松井与郭忠杰秘密会见，对双方想达到的目的心照不宣。
松井出了饭店，两拨跟踪者分别跟上。
周海生发现与郭忠杰秘密会面的人与松井十分相像。沈啸飞细问刺杀松井当天的细节，怀疑被杀的人不是松井本人。