共30集
从宫中逃亡出来的宫女王宁氏，带着襁褓中的女儿流落民间。20年后，女儿柳如是长成一位绝色才女。一次偶然的机会，她与赫赫有名的文坛领袖钱谦益在秦淮河畔邂逅了，二人由敬慕彼此的才华而心生爱意。在经过无助而无奈的时空等待、感情试探和生活考验之后，二人终于互明心迹并终成眷属。然而一场大的时代变革到来了，宛如一场风暴把两人脆弱的爱情推向危机四伏的边缘。清朝摄政王多尔衮率八旗劲旅兵临南京城下，南明王朝君臣四散，留下钱谦益独撑危局。钱谦益为全城百姓免受涂炭，将南京城拱手相让。多尔衮入城以后，将柳如是软禁在软香阁里劝她归顺。柳如是靠智慧和胆识使多尔衮甘拜下风，使多尔衮意识到，仅仅靠武力是不能使天下一统的。剧中还辅以秦淮众佳丽的故事，将马湘兰、李香君、董小宛、陈圆圆这些红尘女子穿插其中。《魂断秦淮》用了三十集的篇幅，通过一群才子佳人在变幻莫测的宫廷风云里，在改朝换代的历史舞台上的曲折人生道路，全景式地展现明清交替之际的江南社会风貌，以及满汉两个民族在血与火的洗礼中逐步融合的悲壮历程。
为了与以往的一切告别，柳隐改名为柳如是。可是，当柳如是回到马湘兰所在的月娇楼，马湘兰根本不放她们进门。马湘兰此时已非妒意发作，她是真心希望柳如是能够与钱谦益成就眷属，所以有意相拒。希望逼柳如是投奔钱府。可是钱谦益为避情债，已经回常熟老家。无处存身的柳如是，又被一直尾随护送的陈玉龙接回了菊园。李盖发现寇白门新凤居挂牌，打上门去。勒令她赎身。结果寇白门只愿从他习武却不愿离开新凤居，因为本来就没打算接客的她，情愿留在这里，威胁老鸨，保护其他姐妹不受欺凌。李盖对寇白门开始刮目相看。这时，柳如是已经无法面对陈玉龙的热忱期待和他妻子的贤淑退让，最后还是离开菊园，回到月娇楼。马湘兰本已面对债主的逼迫凌辱，如是的到来是她临终前的最后安慰。柳如是回来后杨连友密报青龙，青龙尚未动手，就被即时赶到的李盖所杀。