共36集
该剧改编自猫腻同名畅销小说，承接上季，范闲（张若昀 饰）率领使团回归途中，二皇子以费介、范思辙以及滕家遗孤的安危来威胁范闲，逼他向自己俯首称臣，二人的矛盾就此激发。范闲所面对的抱月楼迷局，以及接踵而至的春闱危机，都是二皇子精心给范闲布下的陷阱。范闲与林婉儿如愿大婚，紧接着，范闲接手内库，却发现内库负债累累。 范闲拒绝了庆余堂大掌柜的相助，决定靠自己的力量解决内库危机，范闲相约城中众商贾相聚苍山，以售卖“库债”为机筹集了两千多万银两，解决了内库空虚问题。悬空寺上，庆帝遭遇三连刺杀，范闲出手相救却导致武功全废。危机四伏，压力陡增，范闲别无选择，他必须以这样的身体下江南，挑战庞大的势力与既定的游戏规则，以求彻底夺回内库。
庆帝带范闲来到悬空庙，不但给他讲了叶轻眉的故事，还承认范闲是他和叶轻眉的孩子。当年，叶轻眉生下范闲就被残忍杀害，庆帝刚刚登基帝位未稳，他迫不得已把范闲送到澹州，范闲早就从肖恩口中得知自己的身世，假装刚刚知道此事，他表现得既激动又吃惊，就连一向多疑的庆帝都没看出他在演戏。
庆帝对范闲寄予厚望，让他伤愈以后去江南接管叶轻眉留下的三大坊。范闲和庆帝父子相认，可他却感到一丝不安，他明显感觉到庆帝对他的真情之外还有所忌惮，这让范闲不寒而栗，他向范若若倾诉心中的纠结。范闲来到京都这么久，经历了无数次生与死的考验，因为这次在悬空庙冒死救驾感动庆帝，庆帝才肯与他相认，范闲不知道他在庆帝眼里是儿子还是棋子，范建虽然不是范闲的亲生父亲，可他对范闲的感情是纯粹和真实的。
范若若劝范闲回澹州过平平淡淡的日子，范闲不甘心就这样坐吃等死，他决定去江南看看。五竹带伤回到范府，嘴里不停地说让范闲去江南三大坊，林婉儿质问五竹是不是杀了林珙，五竹对此供认不讳，林婉儿发誓要杀了五竹给林珙报仇，可现在不是时候，范闲这次去江南，李承泽和李云睿肯定会派人暗杀他，希望五竹保护范闲，五竹承诺等范闲不再需要他的时候，他的命就任凭林婉儿处置。
范闲今日启程前往江南，他乘坐一艘超大的官船，李成儒，李承泽，李承乾和李承平一起上船来给他送行，范建和柳如玉随后赶来，范闲决定从江南回来就正式到范家祠堂拜祖宗，一再强调他是范家子孙，在场所有人都大吃一惊，李承乾欣喜若狂，范闲入了范氏宗祠，就不能和他争夺皇位。李承泽对李承乾嗤之以鼻，提醒范闲此行处处小心。
庆帝让李承平跟着范闲去江南，李承平高高兴兴留在船上，范闲拜托洪竹照顾好庆帝。范建提醒范闲做事三思，江南明家执掌三大坊多年，人际关系错综复杂，稍有不慎就会带来很多麻烦，范闲一一记在心里。柳如玉反复确认范闲真的要进范家祠堂，她别提多开心了，范建也感动地热泪盈眶，希望范闲早日凯旋，即使将来范闲一无所有，他也养得起，范闲心里热乎乎的，他从范建身上体会到父爱如山。
大船即将起航，范闲一直没有见到林婉儿，他的心情很失落，范闲突然感觉到林婉儿来送他，赶忙到甲板上来，远远看到林婉儿来给他送行，他们俩四目相对，所有的恩怨顷刻间全部化解，两个人洒泪告别。
大船一路南下，很快来到沙洲水域，沙洲水师守备许大人派人划着一搜小船来给范闲送礼，王启年让人把礼箱吊上来，沙洲知府也派人来送礼，王启年让史阐立一一记录下来，紧接着沙洲各地官员纷纷来送礼，范闲都照单全收。
几艘小船缓缓靠近范闲乘坐的大船，船上大都是白发苍苍的老者，王启年一眼就看出他们不是来送礼，倒像是来鸣冤的，范闲怀疑这些人和明家脱不了干系。与此同时，李承泽和谢必安快马加鞭赶往江南，直接来找明家家主明青达谈判，家财万贯的明青达态度谦和，身穿破旧衣服，李承泽看出他是故意装的，猜到明家真正的掌权人明老太太就在旁边房间看着他们。明老太太只好出来见李承泽，李承泽提醒他们把三大坊牢牢抓在手里，不要交给范闲，明老太太不敢违抗圣命，李承泽大骂明家是朝廷的狗，他早已经断了明家的后路，明青达敢怒不敢言。
李承泽打着明家的旗号下发追杀范闲的悬赏令，各路豪杰趋之若鹜，他还重金收买明家收留的江北逃难来的流民去砸范闲的大船。明老太太不想听李承泽啰嗦，借口睡午觉给他下逐客令，李承泽气得咬牙切齿，对他们威胁恐吓一番。明青达怀疑明家有人投靠了李承泽，否则悬赏令根本无法下发，明老太太不许他胡说，还罚他用针刺自己的手指以示惩戒。