共20集
《红色档案》共分为五个系列，每四集讲述一个惊心动魄的故事。正义与邪恶的生死较量，光明与黑暗的直面冲突。公安干警面对狡猾凶残的毒枭，面对丧心病狂的劫匪，以其警察身份特有的机智与英勇，将罪恶的乌云击得粉碎。它一方面强有力地体现“公安题材”一贯的气势恢宏、荡气回肠；另一方面则利用每一个4集的短单元，浓缩所有镜头的精华，全力专一地刻画每一个英雄的光辉形象，讲述他们的传奇事迹。 公安题材电视剧与广大观众的最大共鸣在于———题材的真实性，即现实社会生活中的正义与邪恶，光明与黑暗的较量，情感与使命的冲突。张翼说，《红色档案》直接取材于当代的中国公安英模。他们中有与歹徒英勇搏斗壮烈牺牲的铁血烈士，有与黑恶势力机智斡旋的公安英模，也有与腐败现象不屈不挠斗争的反腐斗士———他们的姓名，个个有案可查，他们的光荣事迹，桩桩有据可考。
强奸案刚刚了结，四大队便又接到了新的报案，一伙手持双管猎枪的歹徒正在港口欺行霸市，以阻挠村民将蟹苗运往东北。歹徒一方气焰十分嚣张，有近百人手持凶器，眼看价值五十万的蟹苗就要死亡，在调集武警己为时过晚的情况下，董队看准时机擒贼先擒王，以凛然正气制服了首犯熊二，维护了广大群众的经济利益及人身安全，后才得知此伙歹徒都是李的手下。董队在关注梁、宋二犯的同时，更多地与李战飞展开了正面交锋，但由于李用金钱建立的关系网盘根错节，使得他多次逃脱了法律的制裁。