共37集
五百年前的大明京城，一家小医馆里生活着一群乐呵的年轻人。一天，医馆馆主离奇失踪，徒弟朱一品随后收到一个卷轴，无意中打开后，天生的神速记忆让他快速阅读并记下了卷轴的内容，之后就晕厥过去，卷轴也随之烧成灰烬。东厂西厂得知后，派麾下高手杨宇轩与柳若馨前来医馆卧底查探卷轴里的秘密，阴差阳错，他们和朱一品卷入一个个离奇案件。新人入局，也打破了医馆往日的平静。柳若馨年轻貌美，杨宇轩高大英俊，朱一品、赵布祝似乎都被柳姑娘所吸引，陈安安故意要跟杨宇轩亲密互动，期间杨宇轩的前女友、锦衣卫副千户聂紫衣也进来搅局，无数种可能都在小小的医馆里悄悄发酵。朱一品带领的医馆神探小分队踏上冒险之旅，披荆斩棘，将一桩桩迷案及其背后的惊天秘密一一揭开。
晚上柳若馨潜入济世堂把赵奔三救了出来。第二天安安知道赵奔三跳槽到济世堂去了，她跑到对面大闹了一场。济世堂的小二跑来告诉苟老板赵奔三不见了。
江洋大盗段英雄连续作案十分猖狂，汪公公下定决心要抓住他。他请出赵奔三让他开天眼做法画出段英雄的藏身之地，赵奔三拿着两片树叶蒙住双眼，口中念念有词，不一会儿就画了幅地图出来。汪公公认出画上的建筑就是清凉寺，官兵们急速赶到清凉寺抓段英雄，朱一品三人也远远的跟着在清凉寺外观看。一会儿工夫就看见官兵们从寺内抓出一个和尚，朱一品看到这个和尚神情呆滞觉得有些不对劲。段英雄费尽心思躲到清凉寺里，如果被抓必然会有一番挣扎，可是这个段英雄却好像早已经知道自己会被抓，毫无反抗的意思。
朱一品三人装扮成狱卒来到大牢看望段英雄。段英雄头上的戒疤还有血迹，朱一品断定他是最近两三天才到寺里去剃度的。朱一品问段英雄为什么会轻易被官兵捉住，却发现段英雄已经被割去舌头。大家都觉得太残忍，让段英雄把割去他舌头的元凶写下来。段英雄在地上写了一个汪字，他看到柳若馨时显得很害怕。朱一品和杨宇轩认为这件事情是西厂做的，他俩都用异样的眼光看着柳若馨。
柳若馨问义父为什么要割掉段英雄的舌头，汪公公说这一切以后柳若馨都会明白的。西厂用轿子把赵奔三送了回来，并赏赐赵奔三一千两白银。安安和赵布祝看到白花花的银子眼睛都直了，然而赵奔三却说他们不该留下这些银子，又让小童告诉大家自己要闭关三天。朱一品隐晦的问赵奔三是不是得了自己不该得的名声，赵奔三听了恼羞成怒。
朱一品告诉杨、柳二人赵奔三根本不是什么神算，但是又想不出西厂要利用赵奔三的原因。在朱一品和杨宇轩的逼问下，柳若馨说出了实情。赵奔三是她抓的，段英雄也是她抓的。她早就知道段英雄喜欢吃烟云楼的香肠，所以早就安排好了眼线在那里等着段英雄。但至于汪公公为什么要布赵奔三这样一个局她也不得而知。皇上下圣旨让赵奔三进宫与各位大臣商量要事，朱一品三人商量着要进宫探个究竟。