共48集
《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。 本部历史侦探悬疑系列电视剧《神探狄仁杰》，已有四部推出，部部故事悬念迭出，情节扣人心弦，《神探狄仁杰5》也即将在2014与观众见面。《神探狄仁杰》系列电视剧不仅融合扑朔迷离的悬疑剧情与恐怖的视觉元素为一身，更加入了李元芳与狄如燕的爱情、狄仁杰与曾泰的师生之情、以及武则天与狄仁杰的君臣际遇等情感戏码，使得本系列电视剧在惊险刺激的段段案件中增添了不少温情色彩。
不幸事情终于发生了。沙漠像上帝筛糠一样颤抖起来，黄色的沙暴以排山倒海之势扑向铁甲军。数十米高的沙墙呼啸奔腾，以摧枯拉朽之势，将铁甲军车驾人马席卷抛洒腾空四散。就在全军茫然挣扎，饥渴交迫濒临绝望的时候，在夕阳的余晖之中，一彪飘忽诡谲的马队进入了他们迷乱的视野。有人恐怖地断言，这是飘荡在大漠之中的死神降临了。将军房哲已控制不了自己的队伍，他治军再严，又能奈何谁呢？凉州刺史曾泰是狄公的门生。他接到朝廷急报，立即组织抗灾事宜，及时疏散了城中的百姓。想到大漠之中押运饷银的铁甲军，曾泰不免忧心如焚，于是立即派出队伍进入大漠去寻找接应。但是，当援军找到这支队伍时，情形已颇为难以置信。军中所有人都中了邪，而他们押运的饷银，就仿佛被沙暴席卷的沙丘一样，不翼而飞无踪可寻了。这惊天的变故令曾泰瞠目结舌战栗不已。夜里，狄公一行无意中来到一处南北朝时代的古堡。狄公觉得在这荒无人迹的深山中，这古堡建得十分蹊跷，古堡主人解释云云。狄公蓦然想起小庙中供奉的那尊塑像，他觉得小庙和古堡两者之间，某些景象有着说不出的相似。联想起小庙的那个夜晚，他隐隐感到这个古堡主人，这座古堡与小庙和那个奇怪的塑像，似乎有着千丝万缕的联系。