共48集
《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。 本部历史侦探悬疑系列电视剧《神探狄仁杰》，已有四部推出，部部故事悬念迭出，情节扣人心弦，《神探狄仁杰5》也即将在2014与观众见面。《神探狄仁杰》系列电视剧不仅融合扑朔迷离的悬疑剧情与恐怖的视觉元素为一身，更加入了李元芳与狄如燕的爱情、狄仁杰与曾泰的师生之情、以及武则天与狄仁杰的君臣际遇等情感戏码，使得本系列电视剧在惊险刺激的段段案件中增添了不少温情色彩。
狄公真地搬进了何府，并且很快了解到，贩卖私盐的卧虎庄只收纳鸿通柜坊开据的凭信。看来，鸿通柜坊不但参与了邗沟覆船案，而且参与了盱眙私盐案。很可能，鸿通柜坊就是盱眙盐案真正的幕后操纵者，而卧虎庄和葛天霸只不过是它的属下。那么卧虎庄之行，就不光是要查清葛天霸私盐的来路，还要摸清鸿通柜坊在其中扮演的角色。狄公本想抓紧这段空闲时间，先勘破盱眙城中这几宗离奇命案。没想到现在案情竟愈演愈烈，而今，涉案之人非死即逃，凶手的身份更是扑朔迷离。他虽然觉得孙喜望的嫌疑最大，然勘察现场之时，他也发现了几个小小的疑点。突然，狄春飞奔来报，说他和鲁吉英在通衢客栈门前见到了李元芳！狄公见到了李元芳和小青，并且将垂危的彭春救了过来，安排他们及随身行囊也搬进了何园。重逢元芳的激动令狄公缓缓跪倒，向着苍天深深一拜。这是他平生第一次真心地仰拜上苍！苍天有眼呀！他的热泪夺眶而出，可他的脸上却带着笑意。李元芳没有死，这比破获什么大案都要令他高兴！但是，李元芳丧失了记忆，这该怎么办呀？他相信会有办法的。而且，那位昏迷的彭春也十分重要，一旦他醒来道出实情，那么失踪官盐的去向，以及歹人们的屯盐之所便都真相大白了！狄公提醒曾泰等人，元芳的两位朋友小清和庞四身份不明，因此，他们不能贸然暴露真实身份。