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20世纪40年代初,国党军密码专家、懦弱的白大怡被日军诱捕,被迫为日军服务。他无意中发现了一个惊天秘密:日军正在秘密研制一种大规模用于中国儿童的特殊药物,服用者将大脑萎缩,破坏神经组织,心甘情愿被奴役。良知未失的白大怡决意揭穿阴谋,他以故意被“暗杀”而牺牲自己的方式把此秘密传递出去。没多久,延安、重庆均获得了日寇这一险恶计划。延安方面启用了多年潜伏在国民党军统的高级特工林婴婴, 重庆方面则启用了高级特工金深水,以粉碎日寇的阴谋。金深水、林婴婴从此和川岛野夫、小野为首的日军反谍报人员殊死较量。在共同战斗中,林婴成功地策反了金深水加入共产党。金深水在林婴婴牺牲之后,完成了历史使命,粉碎了日寇的阴谋,并公之于全世界。
金深水被老师鸡鸣寺在街上撞着,革灵死后他就怀疑了金深水,当他看到他从裁缝店出来的时心如刀绞,金深水说自己做的一切都是对付日本人,静子无意之中听到他们之间的对话,金深水要他要救出那些无辜的生命,他师傅决定两人同时出枪让老天来做决定,但金深水没办法把枪掏出来对准自己的师傅,但最终他还是开枪打死了师傅。
金深水的师傅在死前夸奖他出手快,并让他去做自己想做的事情,随后鸡鸣寺又朝自己的头部开了一枪。静子听到那些话后悄悄离开,想着以前和金深水在一起日子她哭了。
日本人想取得东南亚的霸权最大的威胁是美国的太平洋舰队,他们打算打击珍珠港的美国主力。川岛将在小孩儿身上的试验情况告诉了中村,中村命他尽快将成人送去做试验。川岛准备用林婴婴来做腾村的活体实验,林婴婴大骂他的卑鄙。
金深水告诉军统领导说莫愁湖为了掩护自己被敌人抓获,他目前的处境也很危险,组织上决定让他冬眠。跪在师傅坟前的金深水也很悲伤,面对国际形势的变化,金深水准备去刺杀腾村,但天皇幼儿园里的布局他们都不清楚,要想刺杀很困难。
林婴婴见到腾村后知道他要用密字白号来对付自己,她和那些孩子成为这批病毒的第一批试验者,腾村决定三天之后试验正式开始。阿牛将小马驹北了回来,小马驹说出了自己的心事儿。静子穿上了日本军装,她见到金深水后问他是否爱过自己,她说了那天晚上发生的事情,金深水也不知道该说些什么。
金深水对静子说他只是想救那些孩子,他恳求她有帮助自己,静子看出了他是在利用自己。静子回去后喝完酒和她哥哥川岛吵了起来,她不明白国家的大东亚共荣。腾村对于日本人重击美国海军的看法和军部并不统一,他想让静子做他的助手。
静子想了一夜后找到金深水,她认为那些孩子是无辜的,她决定帮助他来拯救那些孩子。