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1949 年，国民党拟定了一份“秘杀名单”，上面开列了有起义倾向国民党军高级军官，及国统区的爱国民主人士数十人。共产党中央命令潜伏在国民党国防部的地下党员沈剑秋搞到名单，以保护这批人士。国防部保密局上海中心局局长严敬尧、副局长方汝州、保密局女特工叶梦馨、委员长侍从室特工林怡等人为“秘杀行动”和“秘杀名单”各怀心事。叶梦馨从小被沈剑秋的母亲收养，她深爱沈剑秋；而沈剑秋爱的是女军医夏冰；林怡所爱的画家陶公亮是国民党桂系安插在中共上海地下党内部的卧底，而陶公亮的恋人是沈剑秋的小妹沈若兰。这份“名单”藏在国民党保密局深处，中共、保密局中有意投共的人员、青帮三家盯着，经过惊心动魄的激烈争夺战，最终，“名单”上的大多数人得到了及时的保护。
在严敬尧毛骨悚然的笑声中，保密局准备开始对湖南长沙的军界，按名单展开秘杀。而在上海，保密局又嗅到了上海警备区夏继良等进步军官 的气味。在一系列的准备之后，由严敬尧和蒋恭绰秘谋，要对这些进步的国民党军官大开杀戒，并利用这一机会，试探叶梦辛……
在这次行动中中，叶梦辛所看到的，不是劝降和教化，而是血腥的杀戳……（此时）叶梦辛手提着狙击步枪，闭上了眼睛，眼泪从眼角里一串串地滴落下来……
方苏芸小姐奉方汝州之命从上海来到南京，告诉沈剑秋保密局的暗杀小组已经在去往长沙的路上。在方小姐离开沈剑秋的住所时，保密局的特工跟上了方小姐……为了保护方小姐，沈剑秋从二层窗户跳下，击毙了跟踪方小姐的特工，去了火车站……
而这时，要刺杀沈剑秋的独眼龙，已经化好了装，带着准备好的、用眼镜蛇毒液浸泡过的竹刀，上了火车……
保密局少将处长方汝州，在得知严敬尧去了上海警备区之后，准备让叶梦辛进入严敬尧的办公室，想办法拿到那份秘杀名单……但当叶梦辛在进入了严敬尧的办公室后，一个黑影跟在了叶梦辛的身后……
正当叶梦辛进入严敬尧的办公室，用钢丝丝插入保险柜的钥匙孔时，一双大手紧紧地抓住了叶梦辛，叶梦辛（这时）猛地抽出匕首向后捅去，对方灵活地过这一刀，叶梦辛转身一看，大吃一惊、、、同时楼道里传来脚步声。