共32集
马云飞和高寒婚礼的当天，来了一个不速之客——“五号特工组”的老朋友老于。老于恳请他们再次出山，执行一项特别任务：追查盗窃美国核武器资料的双料间谍吉川猛夫。 为此，高寒跟随欧阳剑平和李智博赶赴云南接受任务，马云飞和何坚也被迫出山，“五号特工组”再次集结。同时，日本人也派出了自己的杀手锏，酒井朝香——她是酒井美惠子的亲妹妹，一个毒辣凶狠的高级女间谍。宿敌相遇，从滇缅到华北，从大后方到最前线，五号特工组和以酒井朝香为首的日特展开了纵横千里的较量，一次次火中取栗，化险为夷，为抗战立下了卓著功勋，酒井朝香最终重蹈了酒井美惠子的覆辙，倒在了“五号”的枪口之下。
众人发现桥本逃走，急忙追赶，终于抓到了桥本，救回了高寒，可是高寒的病情却突然加重，桥本意识到高寒可能濒死，撑不到重庆，提议带高寒回基地治病。
五特经过一番思考，决定冒险同意桥本的意见，回基地救高寒。
五特设计偷盗救护车，快速赶到基地。五特威逼桥本合作，众人混入夏家梁基地，顺利的进入实验室寻找治疗血清。
五特顺利找到药物，将高寒救活。
众人来到接应地点，竟然再次被中村包围!眼看五特要全军覆没，危机之际，桥本为了报复中村(中村曾下令处死桥本)，竟用毒针刺死中村，五特趁机干掉所有日军，顺利回到重庆。 五特逼迫桥本交出病毒资料，重庆终于研制出对付细菌战的药物，彻底解救了万县的受灾百姓。老于奉命来取桥本的技术资料，马云飞把治病资料交给老于，却烧毁了害人的病毒资料。