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公元653年。唐高宗皇位未稳急于用泰山封禅彰显皇威。自认血统高贵的安王李承道，卧薪尝胆图谋夺回皇位。李承道派死士暗中阻杀，泰山封禅在一场腥风血雨中惨淡收场。唐高宗在打击后一蹶不振不理朝政。郦贵妃为了制衡在后宫日益壮大的势力，决定让唐高宗把身处在感业寺中的武媚娘接回宫中。唐高宗借以感业寺修葺进香为名，带着官员们一起去寺里进香礼佛多少以挽回封禅受挫颜面，并顺道把武媚娘接回。狄仁杰带着家丁二宝，为躲避婚约尾随到长安述职的父亲。在父亲的引见下，狄仁杰与国丈爷刑部尚书王佑仁见面，狄仁杰这才发现王佑仁之子王元芳竟是当天在市集上遇到了纨绔公子哥。两人不打不相识，王元芳告诉狄仁杰感业寺最近闹鬼的传闻，约他一同前往探个究竟。却随即发生了一系列恐怖案件……成功破解感业寺疑云的狄仁杰得到唐高宗和武媚娘的欣赏与信任，狄仁杰与在寺中结识的李婉清互生情愫，而元芳与梦瑶也互生好感。几人决定四处游历。一路打打闹闹，也屡遇凶险，经历了鸢尾谷的亡灵案，孤岛魔影案，九天玄女童谣杀人案后，狄仁杰与元芳成为挚交好友，两对年轻人的情感也愈加浓烈。但敏感的狄仁杰却始终感觉到了李婉清对身世难以放下，以及身后一股神秘势力在暗中的蠢蠢欲动……
姜浩然不得不承认，他就是当年那个木匠，并且秦娘是帮凶，喜欢姜浩然二十多年，姜浩然说出事实真相并和秦娘一起葬身崖底。
长孙润泽被关押的时候自己挣脱绳索，并且会合几位堂主假奉皇上旨意将他们就地正法，可是他没想到狄仁杰武功那么高，用麒麟刀将他杀死。树倒猢狲散，几位堂主落荒而逃，下人来报假山后面发现长孙润泽的尸体，狄仁杰判断袭击他们的是假长孙润泽，揭下人皮面具后众人看到死者勾陈的真容，这才知道原来袭击他们的另有其人。
一切尘埃落定，狄仁杰去看望静秋，但是只是寥寥数句就离开了，可是李婉青吃醋了，狄仁杰对婉青解释，他对静秋的感情只是姐姐，是亲人，被狄仁杰这么搅和，婉青一点火气都没了原谅了狄仁杰，两个人卿卿我我之间被二宝发现，略显尴尬。
王元芳对童梦瑶很有好感，他想要跟随狄仁杰一起游历四方，去寻求王大人的同意，王大人觉得出去长长见识也是不错的选择。
杜科也要离开鸢尾谷，临走之前他希望静秋能跟他一起走，可是被静秋拒绝了，她想要一直留在鸢尾谷，她就只剩下狄仁杰临走之前送给她的那只球相伴了。
狄仁杰他们一行人离开了鸢尾谷，这里的一切似乎都不曾发生，但是却又真真实实的存在，有些人注定要成为生命中的过客，只有回忆，没有未来，有未来的人就在自己的身边。