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公元653年。唐高宗皇位未稳急于用泰山封禅彰显皇威。自认血统高贵的安王李承道，卧薪尝胆图谋夺回皇位。李承道派死士暗中阻杀，泰山封禅在一场腥风血雨中惨淡收场。唐高宗在打击后一蹶不振不理朝政。郦贵妃为了制衡在后宫日益壮大的势力，决定让唐高宗把身处在感业寺中的武媚娘接回宫中。唐高宗借以感业寺修葺进香为名，带着官员们一起去寺里进香礼佛多少以挽回封禅受挫颜面，并顺道把武媚娘接回。狄仁杰带着家丁二宝，为躲避婚约尾随到长安述职的父亲。在父亲的引见下，狄仁杰与国丈爷刑部尚书王佑仁见面，狄仁杰这才发现王佑仁之子王元芳竟是当天在市集上遇到了纨绔公子哥。两人不打不相识，王元芳告诉狄仁杰感业寺最近闹鬼的传闻，约他一同前往探个究竟。却随即发生了一系列恐怖案件……成功破解感业寺疑云的狄仁杰得到唐高宗和武媚娘的欣赏与信任，狄仁杰与在寺中结识的李婉清互生情愫，而元芳与梦瑶也互生好感。几人决定四处游历。一路打打闹闹，也屡遇凶险，经历了鸢尾谷的亡灵案，孤岛魔影案，九天玄女童谣杀人案后，狄仁杰与元芳成为挚交好友，两对年轻人的情感也愈加浓烈。但敏感的狄仁杰却始终感觉到了李婉清对身世难以放下，以及身后一股神秘势力在暗中的蠢蠢欲动……
她警告狄仁杰离她远一些，狄仁杰男少轻狂，最起码经过这一夜他们熟识了不少。这时候童梦瑶又来捣乱恰好元芳也在，元芳提醒他们凶手不止一个人让他们一定要小心。
李治和媚娘醒来后，事隔这么久，媚娘能再次给李治梳头，可这时候接受禀报，说是所有马匹都被下了巴豆不能启程。狄仁杰很是想念李婉青，可惜的是童梦瑶总是捣乱，让他们没有机会好好相处。
狄仁杰无意间发现随从二宝在吃野味，他本来也想吃点，可是无意间发现了些奇怪的东西和死去的野鸽子。狄仁杰来到案发现场，元芳也在，元芳提议两个人再比较一番，狄仁杰根本就不在乎输赢就笑着离开了。
欧阳将军他们觉得这件事非比寻常，他们想到这件事会不会和二十年前的那件事有关，欧阳将军警告所有人不要说出去，否则下场很惨。
狄仁杰问李婉青关于鸽子的事情，李婉青说本来有20只信鸽，但是自从他们来了以后就只剩下十只不到的鸽子。狄仁杰和元芳商讨案情，他说赵将军身上并没有伤痕，而且张金鹏并不会武功，狄仁杰说那要不要再比试一次，元芳问他对尸体推断是从谁那学来的，狄仁杰笑着回答童梦瑶，元芳对童梦瑶越来越感兴趣。狄仁杰夜晚收飞鸽传书约他一见，元芳来找童梦瑶请教尸检问题。
原来，约见狄仁杰的是张大人，无意间他撞见了明空和某个人在交谈，狄仁杰问询明空神像流血泪的事情，明空跟他说了些，最后明空对狄仁杰说无论他做什么都不会伤害皇上的。