共21集
《洗冤录》著于宋代，是法医史上的惊世巨著，其作者却是一个饱受歧视的棺材遗腹子。在棺材中出生的宋慈被视为灾星，幸得好朋友薛丹的祖母抚养长大，更与丹和查小灿成为好朋友。长大后，慈遭人诬告后被判死刑，却身遭雷殛。送到义庄后却遭看守的马贵救回，相处后，慈更从贵身上学会了验尸。因分地纠纷而找村长理论的宋慈与劫富济贫的江湖女贼唐思意外地卷入了谋杀村长的案中，被判死刑，后得到新知县宋翊及熟悉验尸的马贵相助，沉冤得雪。宋翊聘宋慈为忤作，两人合作屡破奇案，声名大噪。唐思因宋翊救命之恩，暗生情愫，但宋翊已与聂枫发展感情。这时一名长相与宋翊一模一样的人突然出现，原来假宋翊为求功名，将真宋翊推下山崖冒名顶替，做起了知县;后又攀附权贵，抛弃聂枫而娶富家女蓝彩蝶为妻，岂料蓝家早已外强中干，负债累累。 假宋翊感到彩蝶是他的负担，故设计陷害。其险恶面目渐渐表露，但他每次行凶时均非常谨慎，都要彻底毁尸灭迹。宋慈无计可施之际，意外地发现了真宋翊的尸体，经过艰苦地调查取证，在唐思和聂枫的帮助下，最终惩戒了凶手，伸张了正义。
（大结局） 彩蝶不堪刺激割脉自尽，幸聂枫及时救她。聂枫到义庄找宋慈，见他意志消沉，劝他不可放弃。唐思为开解宋翊，特地邀请他游湖、茗茶。宋慈想通一切并与聂枫研究药理图找新证据。宋诚试探宋翊后对他生疑，并到旧居回想往事，正欲移开天井花盆之际却遭宋翊下毒手，并将现场造成意外失火一般。宋慈循宋诚留下的线索，在天井下找到一具腐尸，相信这才是真的宋翊。宋慈欲以「滴血验骨法」验证宋翊身分，却失败，还被收押监房。宋翊告诉唐思不愿留在伤心地，唐思提议保荐他上京。 宋慈从聂枫所送之牛骨汤想出滴血验骨法失败原因。心如向薛丹表白爱意，更鼓励他再考取功名，薛丹信心大增。彩蝶听信宋翊之言，作假证供指宋慈为主谋，宋慈被判秋后处决。 众人冒险劫狱救宋慈，宋慈避至义庄，在米铺腐尸衫中发现新证据。宋慈为免连累众人，宁回狱中等候处决并著手编撰《洗冤录》流传后世。行刑当日，刽子手大刀一挥之时，远材出现......宋慈能否为自己平反？他在唐思及聂枫二人中如何取舍？收看洗冤录大结局自会真相大白。