共65集
商纣王时代，天界神位空缺，世间人妖杂处，乱象横生。凡人少年杨戬，在一次与狐妖的遭遇中意外开启了天眼。万年狐妖附身于冒名救主的侍女小娥，造就了一代妖妃“苏妲己”，此后纣王设置炮烙酷刑，诛杀重臣，使得商朝统治迅速走向崩溃。元始天尊决定借商周大战完成封神大计，他的三个门徒——姜子牙、申公豹、玉鼎真人，各领师命下山。姜子牙历经磨难，终于统率仙界，辅佐周王之路。申公豹则成为妖界首领，为争夺神位与姜子牙展开了漫长的斗争。玉鼎真人为救人类栽培杨戬，杨戬却凡心顽固，最终凭着对小娥爱情的执着，竟意外完成了使命。武王伐纣之时，妖仙二界决战，双方最终同归于尽。元始天尊说出两份封神榜单的真相，申公豹拒绝接受，投海自尽。姜子牙最终成为封神之人，将二榜合一，公平分配了天界的神位，而世间从此归属人类掌控 。
乾明宫，商王为王后一事深感烦忧，他始终不相信王后会做出这种事情，妲己附合着商王，称她也不相信此事是王后所为。正在这时，子虚来到妲己身边，他设计让商王昏睡过去，将妲己的下一步行动告诉妲己，妲己只要让商王亲自审问王后即可，剩下的一切他自有安排。黄妃求见商王，她将王后喊冤拒不招认的事情告诉商王，商王本想让武成王亲审王后，妲己却按照计划劝商王亲审王后，商王毫不犹豫听从了妲己的意见。
王后召见殷郊，她已为殷郊选好南伯侯的二女儿为太子妃，殷郊不肯接受王后的安排，他心底里只有小娥一人，王后坦言告诉殷郊，殷郊的婚事关乎他的未来，必须选一个强劲有力的后盾，纵然殷郊再喜欢小娥也不可能立小娥为太子妃。王后想让殷郊听自己的话，可殷郊却提起王后跟商王之间的关系，称他不想步王后后尘，娶一个自己不爱的女子为妻，终身不幸福。
元始天尊召回姜子牙，要求姜子牙杀了杨戬，黑天眼的气息已经觉醒，若是黑天眼彻底爆发，三界将经历一场大难。姜子牙不肯杀杨戬，元始天尊却不愿再对杨戬留情，他警告姜子牙，此次若是姜子牙不杀，他便会亲自杀了杨戬。一场梦惊醒后，姜子牙看到了身侧的轩辕剑，始终不知道自己该如何选择，他既不想伤害杨戬，又不愿违背元始天尊的命令。
殷郊离开后，王后郁郁寡欢地回想起自己初进后宫的情景，那时候的商王还懂得体谅她，而现如今早已物是人非，她也早已丢失了自己的幸福。正在这时，商王带着黄妃与妲己来到宫中，要求王后如实招供，王后拒绝招供，连声喊冤。看着王后这副倔强模样，商王准备对王后动刑，妲己却拦住了商王，称她有几句话想跟王后说。妲己以诛九族的大罪威胁王后，希望王后如实招认，王后不信商王真的会杀了她，且她姜氏一族又岂是说灭就灭。商王对王后早已无半点情分，他命人押上刺客，让刺客与王后对质。王后冤屈深厚，可刺客全家老小都在费仲手上，为了全家老小的性命，他只能昧着良心冤枉王后，执意称刺杀一事的幕后主使者是王后。
王后声泪俱下向商王诉说自己的冤屈，斥责商王不分青红皂白的行为与昏君无异，商王勃然大怒，想对王后施以酷刑。幸亏武成王与比干及时赶到，武成王对东伯侯的腰牌十分熟悉，他断定从刺客家中搜出来的腰牌便是东伯侯之物。东伯侯远在塞外，宫中只有一枚腰牌，腰牌正处于商王的寝宫中，王后与比干皆认为定是有人使用了移花接木之计，偷取了宫内的腰牌来设计陷害王后，王后向商王放出最后的狠话，若是此次能在商王宫中搜出一模一样的腰牌，她便甘受千刀万剐之刑。殊不知，子虚早有准备，他已经提前仿制了一块一模一样的腰牌。
宫人在商王寝宫中找出了腰牌，两枚腰牌一模一样，王后已无话可说，她不懂商王为何要逼迫她至此，可商王却无半点夫妻情分，执意对王后上刑。黄妃怨恨王后已久，她主动上前为王后行刑。王后忍受着酷刑，殷郊冲到王后面前，他双眼发红想要杀了妲己，商王徒手拦下了殷郊的剑，要求殷郊跪下。妲己称此事与她并无关系，她让殷郊自己去审问刺客，殷郊执剑对准刺客，他本不想对刺客下手，可子虚却在暗中推了殷郊一把，造成了殷郊杀害刺客的场面。殷郊百口莫辩，商王将殷郊押入大牢。看着商王如今的暴虐模样，王后出言斥责商王听信谗言，是非不分，她坚信商王早晚有一天会遭受天罚。商王听后，一怒之下让人剜下王后双目，准备将王后双目盯在城墙上，看着大商的江山万代千秋。妲己出言为王后求情，可商王却心狠无比，丝毫不念往日的半点情分，亲自剜下王后双目。
申公豹正在激发杨戬的怒气，他告诉杨戬，唯有杨戬体内的黑能量才能助他完成救出妲己，杀了商王，这世间只有杀戮才是公平的，所有的天道都是天人胡乱编造出来的，世上只有他一人才是真正地想帮助杨戬，其余人都是杨戬的对头。小娥在城郊树林找到了杨戬，她想带着杨戬离开，可杨戬却六亲不认，推开了小娥。这时，姜子牙手执轩辕剑来到了杨戬面前，他让杨戬冷静下来，相信他，可杨戬早被申公豹蛊惑，他一心只有报仇，他不再听姜子牙的话，只称从以后他便与姜子牙恩断义绝，再无半点师徒情分。