共65集
商纣王时代，天界神位空缺，世间人妖杂处，乱象横生。凡人少年杨戬，在一次与狐妖的遭遇中意外开启了天眼。万年狐妖附身于冒名救主的侍女小娥，造就了一代妖妃“苏妲己”，此后纣王设置炮烙酷刑，诛杀重臣，使得商朝统治迅速走向崩溃。元始天尊决定借商周大战完成封神大计，他的三个门徒——姜子牙、申公豹、玉鼎真人，各领师命下山。姜子牙历经磨难，终于统率仙界，辅佐周王之路。申公豹则成为妖界首领，为争夺神位与姜子牙展开了漫长的斗争。玉鼎真人为救人类栽培杨戬，杨戬却凡心顽固，最终凭着对小娥爱情的执着，竟意外完成了使命。武王伐纣之时，妖仙二界决战，双方最终同归于尽。元始天尊说出两份封神榜单的真相，申公豹拒绝接受，投海自尽。姜子牙最终成为封神之人，将二榜合一，公平分配了天界的神位，而世间从此归属人类掌控 。
姬昌母亲问起了姬发的下落，姬昌称伯邑考已派人暗中保护姬发，姬发一切安好。听到姬发平安无事，姬昌母亲这才放下心来，她只希望姬发能懂得姬昌的一片苦心，且日后西岐她要让姬发回来掌管。
姜子牙的三魂七魄里缺了最重要的一魄，元始天尊为救姜子牙只好逆行天命，让姜子牙归来。姜子牙现身，因玉虚宫灵气充沛，所以元始天尊能助姜子牙化出人形，可姜子牙一旦落入人间，他还是口不能言，足不能行。姜子牙尚有一魂一魄还在人间，就藏于打神鞭中，这一魂一魄需要姜子牙自己下凡寻回，只有用打神鞭在姜子牙的肉身上打七七四十九下，才能聚集姜子牙的魂魄。姜子牙心系着自己的老婆女儿与杨戬，他迫不及待想回到人间，元始天尊却让姜子牙深记身上所肩负的重任，他告诉姜子牙，殷商气数已尽，他要求姜子牙辅佐西岐，助周灭商，杨戬身负神通，乃应命之人，且与姜子牙又是师徒关系，二人可齐心协力完成大业，让人间祥和，消除三界的灾难。同时，元始天尊叮嘱姜子牙要保密此事，除了杨戬之外，此事不得对第三个人提起。
王后死后，坤德宫便变得死气沉沉，杨妃因王后的死而难过不已，妲己劝杨妃少来坤德宫，以免让自己惹祸上身。杨妃不畏惧宫中的流言，她告诉妲己，冀州与王宫中所有的一切灾难都因妲己而起，妲己可以享受一辈子的荣华富贵，但她一生都永远得不到她内心最想要的东西，只要杨戬活着一天，妲己便不可能安心一天，她今生都会躺在商王的怀中为情所熬，为情所困。
元始天尊召集三位徒弟，他将天下封神之大计告诉三人，天宫之中有三百六十五个神位虚席以待，此次人、妖、仙三界无论尊卑身份，皆可封神。姜子牙、申公豹与白鹤是昆仑山的嫡传弟子，元始天尊准备在三人之中找出一位去完成封神大计。白鹤童子自知道行低微，他明智退避封神一事，申公豹想为自己争取，可元始天尊却称封神大事与三界攸关，申公豹身怀执念，不配担此大任。元始天尊问起了姜子牙的意见，姜子牙虚心称若是元始天尊将此任务交给他，他自当尽力完成。姜子牙向元始天尊说出了自己对封神大计的见解和看法，申公豹不满元始天尊对姜子牙的偏心，他想争取封神大计的重任，可元始天尊却提起申公豹的罪行，他准备收回申公豹在玉虚宫学到的法力，将申公豹逐出玉虚宫。白鹤与姜子牙出言替申公豹求情，可元始天尊却只将姜子牙打落人间，再夺了申公豹的法力，将申公豹逐下山去。上次申公豹私自下凡已沾染了人间的因果，种下了祸根，解铃还需系铃人，元始天尊深知，封神大计若想完成，既少不了姜子牙，也少不了申公豹的干预。
妲己让子虚带着她到冀州城的羊肠小道走一走，这条小道有着她跟杨戬的一切回忆，看着妲己的落寞背影，子虚心底难过，明明妲己为复仇已经割舍掉了一切感情，可却还是割舍不掉对杨戬的感情。妲己独自一人站在小道上，她享受着片刻的心安，幻想着杨戬会陪着她一起走完这条路。妲己生活得并不幸福，子虚想要帮妲己回到杨戬身边，可妲己却执意继续在报仇这条路上走下去，她恶迹累累，已无法回头，只能一路走到底。
姜子牙回到人间，杨戬向姜子牙忏悔，他已悟出了大善大恶的道理，看到姜子牙安然无恙地出现在自己的面前，杨戬喜极而泣，连忙将消息告诉了马小红一行人。姜子牙缺少一魂一魄，口不能言，足不能行，杨戬一行人误以为姜子牙是还有念想未完成，他们想完成姜子牙心愿，故把姜子牙将神仙一样供奉，想让姜子牙动一动。姜子牙心底着急，只好趁着几人不注意之时施法将绑着打神鞭的扫帚抱在自己身上，可杨戬与兰盈、小娥又猜错了姜子牙的心思，他们误以为姜子牙是想抱着花，故将扫帚换成了花，继续供奉着姜子牙。
姬昌出发前往朝歌，百姓纷纷前来送别姬昌。前往朝歌途中，姬昌在古墓前发现了一大声啼哭的娃娃，姬昌通晓天数，他深知自己命中有百子，而今日意外得此麒麟算是功德圆满。