共65集
商纣王时代，天界神位空缺，世间人妖杂处，乱象横生。凡人少年杨戬，在一次与狐妖的遭遇中意外开启了天眼。万年狐妖附身于冒名救主的侍女小娥，造就了一代妖妃“苏妲己”，此后纣王设置炮烙酷刑，诛杀重臣，使得商朝统治迅速走向崩溃。元始天尊决定借商周大战完成封神大计，他的三个门徒——姜子牙、申公豹、玉鼎真人，各领师命下山。姜子牙历经磨难，终于统率仙界，辅佐周王之路。申公豹则成为妖界首领，为争夺神位与姜子牙展开了漫长的斗争。玉鼎真人为救人类栽培杨戬，杨戬却凡心顽固，最终凭着对小娥爱情的执着，竟意外完成了使命。武王伐纣之时，妖仙二界决战，双方最终同归于尽。元始天尊说出两份封神榜单的真相，申公豹拒绝接受，投海自尽。姜子牙最终成为封神之人，将二榜合一，公平分配了天界的神位，而世间从此归属人类掌控 。
费仲闯进苏府，想要知道杨戬的下落。苏夫人不忍再将杨戬推向深渊，她坚决不肯透露出杨戬所在之处，为了不牵连妲己，苏夫人在费仲面前自杀。她倒下之时看着费仲，明确告诉费仲，她就算是死，她的灵魂也要看着费仲遭到报应的那一天。之后，费仲离开，杨戬匆忙赶到冀州城，却还是迟了一步，冀州城内遍地尸体，杨戬在家中找到奄奄一息的苏夫人，苏夫人将纣王为夺走妲己，派大军讨伐冀州，妲己为救全城百姓，舍身进朝歌的事情告诉杨戬，且她希望杨戬能够离开冀州城，忘记冀州城内所发生的一切，好好活下去。苏夫人死在杨戬的怀中，杨戬悲痛不已地触发了额间的黑天眼，却因承受不了黑天眼的能量而晕了过去。
元始天尊察觉到黑天眼的气息蠢蠢欲动，申公豹自请下凡斩杀杨戬，可元始天尊却来到姜子牙面前，他把轩辕剑交给了姜子牙，命姜子牙下凡除掉杨戬，杨戬乃半人半仙，必不能留。姜子牙轻易地拔出了轩辕剑，他不愿意杀人，因此恳求申公豹替他讨情，可申公豹却不满元始天尊对姜子牙的器重。申公豹接过了姜子牙的轩辕剑，发觉自己竟然无法拔得出轩辕剑，元始天尊已经命姜子牙去杀杨戬，申公豹只好将剑归还给姜子牙，心中十分不甘地嘱咐姜子牙要好好完成任务。
妲己进朝歌途中传来一阵琴音，众将士们都晕倒在地，杨戬出现在了妲己的视线中，妲己心中欣喜地上前与杨戬相拥。杨戬向妲己诉说他的深情等待，希望妲己能随他离开，可妲己却心细地发现眼前之人并非是自己的哥哥杨戬。见身份已经暴露，子虚也不再掩饰，他露出真实身份，一脸贪婪地看着妲己的清澈灵魂。子虚想同妲己做交易，他希望妲己主动交出灵魂，他可助妲己完成愿望。妲己宁死也不肯出卖自己的灵魂，子虚意外于妲己的刚烈，他表明他愿意等妲己，且他认为妲己会有自愿交出灵魂的那一天。
武吉将杨戬带回自己的住处，姜子牙奉命前来斩杀杨戬，心善的姜子牙迟迟下不了手。就在姜子牙准备逼迫自己下狠手之时，杨戬的黑天眼突然散发出光芒，姜子牙从中看到了杨戬的未来，杨戬并非是祸乱三界的灾星。恰巧这时，武吉归来，他深怕姜子牙要对杨戬不利，故紧紧地圈住了姜子牙，姜子牙十分意外武吉的力气之大，他遭到了武吉的阻止，故顺势而下丢下轩辕剑离开，没有杀杨戬。待姜子牙离开后，申公豹来到杨戬的面前，他自称他乃是来自昆仑山的道长，可助杨戬解除身上的诅咒封印，武吉误信申公豹，申公豹表面虽是帮助杨戬，暗地里却想夺取杨戬的黑天眼。看到杨戬痛苦难忍，武吉方才知道自己上当，可他一介凡人并非是申公豹的对手，申公豹对武吉出手，继续夺取杨戬的黑天眼。
姜子牙丢失轩辕剑，他想重新回去寻找轩辕剑，可树林里却突然发出一道耀眼光芒，元始天尊知道了二人在凡间的所作所为，怒气冲冲将二人押至仙界。姜子牙向元始天尊解释，他之所以没杀杨戬是因为遭到了武吉的阻止，且他在杨戬身上看到了杨戬的未来，杨戬并非是祸乱三界的灾星，而是拯救三界的大英雄，他相信只要对杨戬善加引导，杨戬必会走上正途。申公豹否定了姜子牙的话，认为杨戬必是灾星，且他出现在人间是为帮助姜子牙斩杀杨戬。元始天尊听了二人的解释，认为姜子牙身处天界，心系凡尘，好不容易修来的慧根都被凡尘混淆，所以他将姜子牙逐出天界，永世不得修仙。姜子牙被贬下凡尘后，元始天尊提起了申公豹想盗取黑天眼的罪行，认为申公豹妖性未除，更应该受到大惩，故将申公豹打出天界。轮回道中，姜子牙遇到了师兄仙鹤童子，仙鹤童子虽不知元始天尊为何十分器重姜子牙，却还是奉命将打神鞭交给了姜子牙。
朝歌，妲己的马车没有人也没有马，自己跑到了朝歌境内，这行为令百姓们十分震惊诧异，不知妲己是人是妖。