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事讲述了省厅通缉两年的毒枭马洪武被秦长岭抓获。不料，一向办事谨慎的秦长岭却被马洪武设计陷害。马洪武在秦长岭的眼皮底下逃跑，不但杀死证人，而且诬陷秦长岭为杀人凶手。秦长岭从此独自走上万里追踪之路。二人几经生死，斗智又斗勇。两人在戏中上演了一出勇气与智慧的较量。平罗县缉毒大队队长秦长岭因抓获毒贩“小棒子”，获知大毒枭马洪武藏匿之所，几经周折将马缉拿归案。马却不惜自残，制造保外就医机会，同时指使手下绑架秦的女儿，马趁机逃脱。秦长岭誓要将马抓回，却不料被马栽赃陷害。秦长岭沦为犯罪嫌疑人，并且很快被捕，为洗清罪名，他设法从公安局逃脱，循着线索，只身踏上抓捕马洪武的万里追凶路。追凶路上，他遭遇劫匪，躲避通缉……历尽艰辛，终于将马再次抓捕。秦的罪名洗清了，可押解马返回途中，却因再次遭遇毒贩，不慎带着马开车闯入“疫区”，险些感染重病。秦长岭和马洪武被隔离在疫区，马的手下又欲将马解救分享者电视。紧急时刻，公安干警配合秦长岭，终将马洪武成功押回。但马拒不交代所藏毒品下落。为找到毒品，抓捕幕后大买家，秦故意将马放走。就在马与买家接头交易时，秦长岭带领公安干警将他们一举抓获。
原来是大棒子给秦长岭打的电话，因为他发现马洪武在车子掉到山沟里之前就已经跳车逃跑了。
来到马洪武藏身的宾馆，秦长岭与马洪武在宾馆大厅狭路相逢，马洪武留下自己的马仔与秦长岭枪战，自己急忙逃走，不料在门口遇到等着的大棒子，为了阻止马洪武逃走，大棒子死死抱住马洪武，却被没有人性的马洪武开枪打死了。可也正是大棒子付出生命的努力，让秦长岭及时赶到，抓到了马洪武。
秦长岭的女儿梦茹和赵明来到了边境，梦茹却忽然发现赵明身上有枪。
为了躲避营救马洪武的人，秦长岭和马洪武意外闯进了疫区。由于整个疫区已经被完全隔离，秦长岭只好先把马洪武带到附近的派出所。
为了能尽快离开疫区，秦长岭到疫区的指挥部找妻子项真，希望她可以给自己和马洪武通行证，谁知妻子为了保证疫情不再扩大，坚决不同意放行。项真随秦长岭来到马洪武关押处给马洪武注射一秒，却发现马洪武已经感染了阿克病毒。
得知马洪武的被抓，境外的毒贩巴海姆再也按耐不住了，亲自来到中国，准备营救马洪武。