共52集
《仙剑奇侠传三》故事的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌，封印被解除开始的。但是，更深层的因果却要追溯到千年前的神界。神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手，一直难分胜负，两人逐渐有惺惺相惜之意。重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗，一较高下。两人势均力敌，比试旷日持久，最终惊动了天庭，天帝派兵捉拿飞蓬问罪，飞蓬因感知到追兵将至而分心，佩剑被重楼打落人间而落败。光阴荏苒，飞蓬被神界问罪贬为人，经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。同时，重楼自魔界窥探人间，偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡，心中动念想要帮助景天，于是来到人间，滋扰蜀山，想要帮飞蓬找回佩剑，无意中毁坏了锁妖塔，偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。景天得到魔剑的同时，结识了唐门小姐雪见，从此改变了自己的生活。一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中，而后遇到蜀山弃徒徐长卿及其未婚妻紫萱，走上了协助蜀山寻找五灵珠，封印锁妖塔的漫漫征途。几个人的情爱纠葛，生离死别反复交织纠缠，雪见的离奇身世，紫萱不为人知的秘密，龙葵长久以来的心中愿望。伴随着人类与妖界死生存亡的争斗，而其实人的欲望，才是所有纷争的本源。
紫萱刻意还把情况说得暧昧来逗弄长卿，长卿信以为真，无所适从。再了解完事实之后，长卿匆匆离去，路上遇上了景天和雪见。三人无功而返，不料回到客栈中，见茂山被严重打伤。待茂山恢复清醒后，众人得知，当日景天众人离去后，龙葵变成红色，她还以神力抬走高老爷。为了解事情真相，众人遇上了圣姑，圣姑表示只要景天戴上头盔，就会明白一切。众人手拉手，景天缓缓戴上头盔。原来，龙葵真的是千年前出生的公主，而景天的前生就是龙阳。一千年前战火连天的姜国，正受着杨国的进攻，濒临灭亡边缘。龙葵作为姜国公主，自幼便在皇宫长大，受尽爱护。可是战争每况愈下，姜国难以再守下去。一直活在温室里的龙葵，终于明白战争的恐怖，她宁愿死，也要与哥哥一起，冲上战场。龙阳为了妹妹的安危，狠下心打断了龙葵的腿，戴上天降宝物——头盔，独自征战。终于姜国亡了，龙阳亦战死沙场，兄妹阴阳相隔。