共52集
《仙剑奇侠传三》故事的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌，封印被解除开始的。但是，更深层的因果却要追溯到千年前的神界。神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手，一直难分胜负，两人逐渐有惺惺相惜之意。重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗，一较高下。两人势均力敌，比试旷日持久，最终惊动了天庭，天帝派兵捉拿飞蓬问罪，飞蓬因感知到追兵将至而分心，佩剑被重楼打落人间而落败。光阴荏苒，飞蓬被神界问罪贬为人，经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。同时，重楼自魔界窥探人间，偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡，心中动念想要帮助景天，于是来到人间，滋扰蜀山，想要帮飞蓬找回佩剑，无意中毁坏了锁妖塔，偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。景天得到魔剑的同时，结识了唐门小姐雪见，从此改变了自己的生活。一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中，而后遇到蜀山弃徒徐长卿及其未婚妻紫萱，走上了协助蜀山寻找五灵珠，封印锁妖塔的漫漫征途。几个人的情爱纠葛，生离死别反复交织纠缠，雪见的离奇身世，紫萱不为人知的秘密，龙葵长久以来的心中愿望。伴随着人类与妖界死生存亡的争斗，而其实人的欲望，才是所有纷争的本源。
夕瑶被天帝贬为花草,在芸芸花草中难以辨认，景天和雪见欲一试。为了找出夕瑶，景天情深吻在雪见唇上。群花如沐春风，夕瑶渐渐现身。夕瑶定定地望着景天，表示现在的景天已不再是飞蓬，她已忘记了飞蓬，叫雪见好好跟景天相爱。雪见为了满足夕瑶的心愿，找景天一同说服天帝，让景天变回飞蓬。穿上战衣的飞蓬果然英俊无比，不过法力只能维持四个时辰。紫萱悄悄进入重楼的镜房里，一个多年来饱受寂寞，高傲的只跟镜子比武的人。重楼发现了紫萱，一手抓着她。突然他见到天界的飞蓬跟夕瑶在神树下。重楼双眼现光芒，他二话不说，拿起最强武器离开。景天和夕瑶对望，一切彷佛回到从前。重楼杀至，景天和夕瑶都感觉到重楼来了，夕瑶有不祥之感，觉得景天再次会因为重楼而离她而去。可为了大家，景天毅然选择和重楼一战到底！雪见担心景天，她先赶去看景天，长卿则先去天池。重楼和景天重温一千年前的比武，景天占下风，雪见忍不住，开口大骂景天无用。景天的好胜心被雪见唤起，拿起剑反击，二人激斗。紫萱望着重楼和飞蓬对打，想起圣姑说的要取魔的心来维持青春。重楼和景天仍在激斗。