共52集
《仙剑奇侠传三》故事的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌,封印被解除开始的。但是,更深层的因果却要追溯到千年前的神界。神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手,一直难分胜负,两人逐渐有惺惺相惜之意。重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗,一较高下。两人势均力敌,比试旷日持久,最终惊动了天庭,天帝派兵捉拿飞蓬问罪,飞蓬因感知到追兵将至而分心,佩剑被重楼打落人间而落败。光阴荏苒,飞蓬被神界问罪贬为人,经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。同时,重楼自魔界窥探人间,偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡,心中动念想要帮助景天,于是来到人间,滋扰蜀山,想要帮飞蓬找回佩剑,无意中毁坏了锁妖塔,偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。景天得到魔剑的同时,结识了唐门小姐雪见,从此改变了自己的生活。一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中,而后遇到蜀山弃徒徐长卿及其未婚妻紫萱,走上了协助蜀山寻找五灵珠,封印锁妖塔的漫漫征途。几个人的情爱纠葛,生离死别反复交织纠缠,雪见的离奇身世,紫萱不为人知的秘密,龙葵长久以来的心中愿望。伴随着人类与妖界死生存亡的争斗,而其实人的欲望,才是所有纷争的本源。
此刻紫萱虽不需要万玉枝的心,但仍出手相救,她表示他中的是水毒,用古藤林里的土灵珠可解。景天等人破除圣姑法术后,只奔荒山小庙,因为在破晓时分,长卿的作法就会完成,到时龙葵将在太阳下魂飞魄散。景天等人好不容易找至庙外,正巧听到龙葵惨叫。后来才得知长卿是在解救龙葵,他施法并输出自己的血来给予龙葵,让她可以像常人一样在日光下生存!一家人终于团聚,雪见主动跟龙葵和解。龙葵事件已解决,长卿拿出通往天界地图,一指古藤林,只要找到那里,就可找到土灵珠。于是茂山留下看守物品,长卿则被安排休息静养。景天等人按照地图来到古藤林外,忽见一只巨猴精精,他能偷所有的东西,大家都觉得精精可爱。精精闻土灵珠,告诉众人土灵珠在古藤老妖那里。大家经过古藤老人,老人提出他能猜出所有人心思,若他猜中,众人必须留下陪伴他;若他输了,就放行。不料老人竟猜不出雪见的心思,原来雪见的来历并非一般,老人猜不出只能让路。