共52集
《仙剑奇侠传三》故事的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌,封印被解除开始的。但是,更深层的因果却要追溯到千年前的神界。神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手,一直难分胜负,两人逐渐有惺惺相惜之意。重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗,一较高下。两人势均力敌,比试旷日持久,最终惊动了天庭,天帝派兵捉拿飞蓬问罪,飞蓬因感知到追兵将至而分心,佩剑被重楼打落人间而落败。光阴荏苒,飞蓬被神界问罪贬为人,经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。同时,重楼自魔界窥探人间,偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡,心中动念想要帮助景天,于是来到人间,滋扰蜀山,想要帮飞蓬找回佩剑,无意中毁坏了锁妖塔,偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。景天得到魔剑的同时,结识了唐门小姐雪见,从此改变了自己的生活。一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中,而后遇到蜀山弃徒徐长卿及其未婚妻紫萱,走上了协助蜀山寻找五灵珠,封印锁妖塔的漫漫征途。几个人的情爱纠葛,生离死别反复交织纠缠,雪见的离奇身世,紫萱不为人知的秘密,龙葵长久以来的心中愿望。伴随着人类与妖界死生存亡的争斗,而其实人的欲望,才是所有纷争的本源。
雪见缓缓张开眼睛,景天又惊又喜之际,长卿和紫萱的仙船驶至,见众人无恙,也十分高兴。众人登船,用尽合力把自身的真气和水分输给她。雪见终于醒过来了,但却一脸木然,全无反应。众人向常胤求助,却发现人世界竟没有雪见的身世纪录。长卿询问清微的身世,清微语带双关说一切上了天界便有答案。长卿驾驶仙船,众人决定立马动身,往天界而去。众人来到一荒山,长卿指出,魔界和天界相连。由魔界进入通过神魔之井,便可登天。众人至魔界入口,仿若一黑色的蝙蝠洞,但始终无法进入。后来花楹发现只要有翅膀便能飞入。于是景天等人打下许多乌鸦,模仿重楼的翅膀,制作数对翅膀状巨物。刚佩戴在身,便被吸入洞口。众人摔落在地,抬头发现魔界守卫。景天和众魔套交情,自称和魔尊重楼相熟,众魔不理,打了起来。