共30集
惊天阴谋是潘军“谍战三部曲”的第三部（第一部《五号特工组》第二部《海狼行动》）本剧根据主要历史事实虚构而成。其中主要事件，如“唐绍仪计划”、“蓝色计划”、“汪精卫投敌”、“河内刺杀汪精卫”、“滇军通电全国”等，都有据可查。这种在广阔历史背景下进行艺术虚构，是作家潘军的一贯风格，使作品厚实凝重。与前两部最大的不同，作者减少了枪战场面，进一步增加了悬疑和惊险，故事一波三折，人物关系复杂而又形象鲜明。剧作开掘了战争和人性的深度，为目前作品所罕见。1938年秋，在“武汉会战”进行之际，日本驻华特务总机关长土肥原贤二亲自制订了一份《唐绍仪工作计划》。这个计划的核心内容，就是在中国的日占区尽快扶持一个伪中央政权，以达到“以华制华”的罪恶目的。滞留上海的唐绍仪是国民政府第一任内阁总理，可谓举足重轻的人物。此时的蒋介石也担心唐绍仪为日本人利用，特命戴笠派专人赴上海送去自己的亲笔信，并将其接回重庆。这个特殊的信使叫凌沛东，他是唐绍仪的养子。凌沛东的父亲曾经是唐绍仪的副官，当年为营救唐牺牲。而中共地下组织也担心唐绍仪的安全，为其挑选了一名精干的保镖孙一樵。没想到的是，凌、孙二人却共同爱着一个女人，她就是《远东日报》的女记者梅岚。凌沛东一到上海，就负伤落到了日军的手里。接着，一个意想不到的事情发生了，土肥原发现，被俘的凌沛东与自己的一个学生中岛健形象酷似，形同孪生！于是，一个巨大的阴谋开始在他脑海中酝酿而成。那就是让中岛健冒充凌沛东打进唐公馆，从此充当唐绍仪的养子，即在未来的中国政府首脑人物身边，安插了一个永远难以发现的眼线，以控制唐绍仪的一举一动。经过仿造凌沛东手臂上的梅花刺青手术，中岛健很快就变成了一个让大家信任的凌沛东。而参与这次手术的人，一夜之间全都遭到了灭口，这其中就包括刺青手术的执行者王安娜大夫。
团军的指挥权转移给副总司令高荫槐将军。
上官婉玉偷偷打开了这名顾问的保险柜，果然，在一次秘密会谈中涉及到这个敏感问题，她立即用微型照相机进行了拍照。离开后，立即拨通了凌沛东的电话。在电话里只说，有紧急情况，要他去她那里一趟。凌沛东偷偷起床，摸出了房门，但是，暗中的凌沛瑶还是被惊动了。
凌沛瑶壮着胆子悄悄出了门，跟随其后。她看着哥哥敲开了一个女人的房门，然后，门又关上了。这次，凌沛瑶看清楚了，原来那个面熟的女人竟然是自己过去的音乐老师上官婉玉！他们是什么关系？他们与唐公馆发生的一切有什么关系？天真的凌沛瑶震惊了。
凌沛东和上官婉玉密谈之后，认为这是一个有利的时机。于是用电台把这个情报及时报告给了上海的土肥原总机关长。
土肥原连夜召开了紧急会议，认为来自重庆的情报很重要，这正是《蓝色计划》一直期待的有利时机。于是回电指示，要趁着蒋介石的这种思路，尽快策动龙云兵变，以扰乱中国军队的阵脚，从而策应缅甸的日军打过怒江，进攻中国的大西南。这又将是一个惊天阴谋！
凌沛东回到了家里。他一进门开灯，发现凌沛瑶正坐在客厅里，眼泪汪汪。凌沛东很是诧异，问怎么了？
凌沛瑶却反问道：你今晚去哪了？
凌沛东说：我去会了几个朋友。
凌沛瑶生气地站了起来，说：你是去了那个妖艳的女人那里吧？
此言一出，令凌沛东出了一身冷汗。他万万没想到，自己的行动居然没有逃过一个小丫头的眼睛。连续两次的发现，使得凌沛瑶不能不怀疑哥哥行为不轨了。
凌沛东只好谎称自己当初和上官婉玉一见钟情，加上梅岚又脚踏两只船，所以就只能放纵一下自己。凌沛瑶很生气，说哥哥这样做对不起梅岚，也令她深感失望，并且说：你以前可不是这样的人啊！凌沛瑶还表示，明天就去找那个上官婉玉。
凌沛东担心自己的行动会暴露，遂动了杀机。他一面对“妹妹”解释，表示以后再也不会了，同时拿出了一根细绳子，准备从背后勒死这个姑娘。就在这个时候，传来了敲门声，凌沛东收了绳子，去开门，一看，原来是孙一樵回来了。这让他顿时慌乱了起来。