共30集
惊天阴谋是潘军“谍战三部曲”的第三部（第一部《五号特工组》第二部《海狼行动》）本剧根据主要历史事实虚构而成。其中主要事件，如“唐绍仪计划”、“蓝色计划”、“汪精卫投敌”、“河内刺杀汪精卫”、“滇军通电全国”等，都有据可查。这种在广阔历史背景下进行艺术虚构，是作家潘军的一贯风格，使作品厚实凝重。与前两部最大的不同，作者减少了枪战场面，进一步增加了悬疑和惊险，故事一波三折，人物关系复杂而又形象鲜明。剧作开掘了战争和人性的深度，为目前作品所罕见。1938年秋，在“武汉会战”进行之际，日本驻华特务总机关长土肥原贤二亲自制订了一份《唐绍仪工作计划》。这个计划的核心内容，就是在中国的日占区尽快扶持一个伪中央政权，以达到“以华制华”的罪恶目的。滞留上海的唐绍仪是国民政府第一任内阁总理，可谓举足重轻的人物。此时的蒋介石也担心唐绍仪为日本人利用，特命戴笠派专人赴上海送去自己的亲笔信，并将其接回重庆。这个特殊的信使叫凌沛东，他是唐绍仪的养子。凌沛东的父亲曾经是唐绍仪的副官，当年为营救唐牺牲。而中共地下组织也担心唐绍仪的安全，为其挑选了一名精干的保镖孙一樵。没想到的是，凌、孙二人却共同爱着一个女人，她就是《远东日报》的女记者梅岚。凌沛东一到上海，就负伤落到了日军的手里。接着，一个意想不到的事情发生了，土肥原发现，被俘的凌沛东与自己的一个学生中岛健形象酷似，形同孪生！于是，一个巨大的阴谋开始在他脑海中酝酿而成。那就是让中岛健冒充凌沛东打进唐公馆，从此充当唐绍仪的养子，即在未来的中国政府首脑人物身边，安插了一个永远难以发现的眼线，以控制唐绍仪的一举一动。经过仿造凌沛东手臂上的梅花刺青手术，中岛健很快就变成了一个让大家信任的凌沛东。而参与这次手术的人，一夜之间全都遭到了灭口，这其中就包括刺青手术的执行者王安娜大夫。
再说， 凌沛东也在这个时候收到了部队的来信。信中要求他尽快归队。一想到自己还要继续扮演这个不情愿的角色，他心灰意冷。那个上官婉玉又来了电话，约他去了郊外的仓库。在这里，凌沛东见到了回国叙职归来的土肥原。没想到，一见面土肥原就大为光火。原来，这次土肥原回东京，假意去慰问“阵亡”的中岛健的母亲和妻子。不料，一见面，两个女人就对他跪下了，求他放过中岛健。她们的邻居三木已经把在上海遇见中岛健的消息带回来了，他没有死，还活着！土肥原这才知道，这个惊天的秘密还是泄露出去了。尽管凌沛东解释了一切，但最后土肥原还是下令杀掉三木，并警告凌沛东，再有闪失，后果更加严重。
医院里的梅岚伤势见好。这天，她无意中发现了一个女清洁工，很像当初去唐公馆的那个“音乐教师”上官婉玉，于是便跟踪而去。这个女人就是上官婉玉，在梅岚住院的日子里，她担心凌沛东假戏真做，所以一直暗中监视着他们。就在梅岚快要逼近上官婉玉时，后者拔出了匕首，正打算将梅岚除掉，身后一扇窗户突然打开，凌沛东一把将上官婉玉拉进了屋里，隐藏起来，躲过了这一关。上官婉玉不屑地问：你这是救我，还是救她？她似乎感觉到，这个凌沛东已经真的爱上了梅岚。正是这种真爱，让梅岚又打消了对凌沛东的怀疑……
孙一樵通过梅岚的一位在76号做秘书的同学，打听到，那天被抓进去的那个女人已经放了，是一个误会。这让曹汉稍许放心了。但那把扇子还在新居的箱子里，必须拿出来才好等待新的接头人。于是，他们又让“水耗子”刘淼帮忙。
是夜，刘淼翻进了曹汉新居，机智地躲开了特务视线，顺利地把那把扇子拿到了手上。同时，这个爱沾便宜的家伙又从箱子里顺了几件东西，其中就包括那只墨镜，江湖上的规矩叫“贼不空手”。等到了船舱，他才看见墨镜还掉了一块镜片，便把它扔到了一边。
一天晚上，曹汉和孙一樵散步，两人谈论的还是怎样才能找到新的联系人？孙一樵建议在梅岚的报纸上登个“寻人启事”。两人正谈着，一辆汽车从他们身边飞快开过，向他们开了黑枪。这一次，从手法上看，不像是特高课，也不像是76号，倒很像是中共地下组织。这时，曹汉明白了，自己已经被组织当作了叛徒。
果然，这次袭击就是中共地下组织干的，指挥这次行动的，居然就是京剧名角秦月容！他们没有成功，正准备进行第二次，这时，秦月容想到了孙一樵。