共30集
惊天阴谋是潘军“谍战三部曲”的第三部（第一部《五号特工组》第二部《海狼行动》）本剧根据主要历史事实虚构而成。其中主要事件，如“唐绍仪计划”、“蓝色计划”、“汪精卫投敌”、“河内刺杀汪精卫”、“滇军通电全国”等，都有据可查。这种在广阔历史背景下进行艺术虚构，是作家潘军的一贯风格，使作品厚实凝重。与前两部最大的不同，作者减少了枪战场面，进一步增加了悬疑和惊险，故事一波三折，人物关系复杂而又形象鲜明。剧作开掘了战争和人性的深度，为目前作品所罕见。1938年秋，在“武汉会战”进行之际，日本驻华特务总机关长土肥原贤二亲自制订了一份《唐绍仪工作计划》。这个计划的核心内容，就是在中国的日占区尽快扶持一个伪中央政权，以达到“以华制华”的罪恶目的。滞留上海的唐绍仪是国民政府第一任内阁总理，可谓举足重轻的人物。此时的蒋介石也担心唐绍仪为日本人利用，特命戴笠派专人赴上海送去自己的亲笔信，并将其接回重庆。这个特殊的信使叫凌沛东，他是唐绍仪的养子。凌沛东的父亲曾经是唐绍仪的副官，当年为营救唐牺牲。而中共地下组织也担心唐绍仪的安全，为其挑选了一名精干的保镖孙一樵。没想到的是，凌、孙二人却共同爱着一个女人，她就是《远东日报》的女记者梅岚。凌沛东一到上海，就负伤落到了日军的手里。接着，一个意想不到的事情发生了，土肥原发现，被俘的凌沛东与自己的一个学生中岛健形象酷似，形同孪生！于是，一个巨大的阴谋开始在他脑海中酝酿而成。那就是让中岛健冒充凌沛东打进唐公馆，从此充当唐绍仪的养子，即在未来的中国政府首脑人物身边，安插了一个永远难以发现的眼线，以控制唐绍仪的一举一动。经过仿造凌沛东手臂上的梅花刺青手术，中岛健很快就变成了一个让大家信任的凌沛东。而参与这次手术的人，一夜之间全都遭到了灭口，这其中就包括刺青手术的执行者王安娜大夫。
此时的曹汉已经陷入了绝境。他有口难辩。孙一樵冲动之余，渐渐冷静下来。他不相信自己最信赖的曹汉是杀害自己父亲的凶手，但证据确凿又不能不信。他审问曹汉，究竟是什么人？
曹汉说：我不能告诉你。即使你把我杀了，我也不能告诉你。
孙一樵说：你是个叛徒！共产党的叛徒！
曹汉说：我决不会当叛徒！
孙一樵想起父亲以前说过的话，要他在曹汉遇到困难的时候帮助他。可是这样的时刻，他只想杀了他。他把曹汉吊了起来。
孙一樵说：你必须告诉我真相。
曹汉说：我只请求你，在你杀我之前，让我找到另一个拿扇子的人。
孙一樵似乎有些明白了，那一次，曹汉就是冒险去和另一个拿扇子的人接头的。可是，曹汉为什么又要残忍地杀害父亲？他百思不得其解。事情就这么耽搁下来了，杀不得，又放不得。万般无奈之下，孙一樵只好先将曹汉捆绑在货轮上。
这时，秦月容也得到了上级的指示，说关于挫败敌人《蓝色计划》的方案眼下并没有泄露，这就意味着曹汉还在严守着这个机密。他们一下意识到，对曹汉的处理可能是草率了。曹汉有可能是被冤枉的！秦月容便立即通过梅岚去找孙一樵，可是这几天孙一樵已经“失踪”了，没有回唐公馆。这下，让两个女人都着急了。因为再晚一步，孙一樵可能就把曹汉给杀了！
唐公馆内，凌家兄妹也在关心着孙一樵，但想法又不一样。凌沛东担心的是孙一樵看出了自己的破绽，故意隐蔽起来；而凌沛瑶则怀疑孙一樵无情地撇下了自己，故意和梅岚制造出“失踪”的假象。她和梅岚再次发生了冲突。
此时的孙一樵内心处在极大的矛盾之中，在把曹汉吊了几天之后，也开始了反省，他实在不能相信曹汉是叛徒，可事实又证明的确是他杀害了许先生。这天，孙一樵去码头上清醒头脑，剩下“水耗子”看守曹汉。趁其不备，曹汉暗中抓住了一块破碗片。等孙一樵离开之后，曹汉就开始割断绳索，终于挣脱出来，把“水耗子”打昏在地。接着，曹汉就偷偷跑走了。
孙一樵回到旧船舱，一看这情形，后悔莫及，这时他觉得曹汉是真的成了叛徒，必须将他除掉。