共30集
惊天阴谋是潘军“谍战三部曲”的第三部（第一部《五号特工组》第二部《海狼行动》）本剧根据主要历史事实虚构而成。其中主要事件，如“唐绍仪计划”、“蓝色计划”、“汪精卫投敌”、“河内刺杀汪精卫”、“滇军通电全国”等，都有据可查。这种在广阔历史背景下进行艺术虚构，是作家潘军的一贯风格，使作品厚实凝重。与前两部最大的不同，作者减少了枪战场面，进一步增加了悬疑和惊险，故事一波三折，人物关系复杂而又形象鲜明。剧作开掘了战争和人性的深度，为目前作品所罕见。1938年秋，在“武汉会战”进行之际，日本驻华特务总机关长土肥原贤二亲自制订了一份《唐绍仪工作计划》。这个计划的核心内容，就是在中国的日占区尽快扶持一个伪中央政权，以达到“以华制华”的罪恶目的。滞留上海的唐绍仪是国民政府第一任内阁总理，可谓举足重轻的人物。此时的蒋介石也担心唐绍仪为日本人利用，特命戴笠派专人赴上海送去自己的亲笔信，并将其接回重庆。这个特殊的信使叫凌沛东，他是唐绍仪的养子。凌沛东的父亲曾经是唐绍仪的副官，当年为营救唐牺牲。而中共地下组织也担心唐绍仪的安全，为其挑选了一名精干的保镖孙一樵。没想到的是，凌、孙二人却共同爱着一个女人，她就是《远东日报》的女记者梅岚。凌沛东一到上海，就负伤落到了日军的手里。接着，一个意想不到的事情发生了，土肥原发现，被俘的凌沛东与自己的一个学生中岛健形象酷似，形同孪生！于是，一个巨大的阴谋开始在他脑海中酝酿而成。那就是让中岛健冒充凌沛东打进唐公馆，从此充当唐绍仪的养子，即在未来的中国政府首脑人物身边，安插了一个永远难以发现的眼线，以控制唐绍仪的一举一动。经过仿造凌沛东手臂上的梅花刺青手术，中岛健很快就变成了一个让大家信任的凌沛东。而参与这次手术的人，一夜之间全都遭到了灭口，这其中就包括刺青手术的执行者王安娜大夫。
第一次刺杀唐绍仪没有成功，令王澍十分困惑。他把此事报告戴笠，后者也觉得蹊跷，难道是自己内部有人通风报信？那这个人又会是谁呢？当时在场的几个人都没有这个可能性。但这次的行动让戴笠对孙一樵产生了兴趣，他当即从国防部调来了孙一樵的档案，并电话指示曹汉，想办法接近这个孙一樵，为军统所用。曹汉把戴笠的意思告诉了孙一樵，两人不禁笑了起来。
蓝色窗帘又让他们想起了死去的王安娜。对于凌沛东的突然回家，孙一樵心中一直是存在着疑虑的。他不能说服自己，围绕这个情报官前后死去了那些人，眼下却烟消云散了。他觉得事情不会这么简单。但是，这次行动凌沛东也是奋不顾身，这又该怎么解释呢？
躲过一劫的唐绍仪对孙一樵很赏识，而此时的凌沛瑶也更加喜欢这个保镖了。唐绍仪看出了养女的心思，便有意来为他们牵线。他对孙一樵说了凌沛瑶的身世，同时也希望他们能走得更近。但是，对这番好意，孙一樵却婉言谢绝了。这让暗中偷听的凌沛瑶很是伤心。她认为，孙一樵还是忘不掉那个梅岚。凌沛瑶独自去见了梅岚，坦率地表明了自己对孙一樵的心思，并希望梅岚能够成全。梅岚心情沉重，但口头上还是答应下来。可是，当梅岚把凌沛瑶的话告诉孙一樵时，却遭到了后者的抵制。两人甚至因为凌沛东的回来发生了争执。冷静下来之后，梅岚才说，这个凌沛东确实和以前不一样了。每次走近他，她都无法感受到过去的气息。梅岚的这种感觉，也引发了孙一樵的思索。
军统刺杀唐绍仪的行动，也惊动了土肥原。他担心如果军统下一次得手的话，那么他的“唐工作计划”就全盘失败，包括处心经营的这个凌沛东，也失去了全部意义。土肥原继之认为，可以抓紧这个有利时机，通过凌沛东去劝唐绍仪归顺了。
这天，那位音乐教师上官婉玉又来到了唐公馆。这次，她主动来到了凌沛东的房间，几句闲谈之后，上官婉玉低声传达了土肥原的指示。这时，凌沛瑶来了，上官婉玉马上换了一副腔调，陪她练琴去了。
刺杀行动让唐绍仪感到不安。他也觉察到这是戴笠的手笔，和当年刺杀杨杏佛如出一辙。凌沛东见时机已到，便开始就汤下面的对唐进行了委婉的劝说，说这次他受伤被俘，日本人对他其实很优待。他甚至说日本并非想谋求中国的领土，只是希望有一个可以合作的中国政府，认为伯父应该出山，救民于水火。不料，唐绍仪更加气愤，认为凌沛东失去了民族气节，并说出了日本的野心就是再炮制出一个伪满洲国，这与汉奸毫无二致。他说自己既不会归顺蒋介石，也不会和日本人合作，如果上海不能住下去，宁可去香港找杜月笙。说着，还出示了刚刚收到的杜月笙给他的信件。
凌沛东吓出了一身冷汗。