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清朝咸丰年末（西元1860年），大清因长期以来的闭关锁国政策，国势已盛极而衰，西方各国凭藉船坚炮利，大举入侵中国。在这个动乱的时代，一段恩怨纠葛的爱恨情仇、揉合保家卫国的壮烈故事就此展开。台湾艋忠义堂武馆，世代相传，济弱扶倾，在地方上颇富威望。忠义堂大弟子魏永来，武艺超群但心胸狭隘、热衷名利，老馆主年事已高，因见永来心术不正，遂决定将馆主之位交由二弟子黄万里继任。永来不堪受辱，愤而叛离师门投效清廷，并扬言誓报此仇！某日永来重回艋，竟以谋逆罪名率朝廷大军攻打忠义堂，老馆主危急间遣散众弟子，自己则为永来所弑，忠义堂一夜被灭！万里赶回师门时，惊见师门被灭、师父身亡，而师弟们均下落不明，连仇家是谁亦不得而知！万里流浪全台四处探访案情，却始终音讯渺茫，心灰意冷之下，遂隐姓埋名，在鸡笼一富商徐老爷家做护院。徐老爷常年往返大陆福建经商，万里与徐家大小姐惠娘日久生情，两人珠胎暗结，生下一子。不料徐老爷返台得知真相后，大怒惠娘有辱门风，于是派人将万里杀死，并狠心将孙子放水流走！惠娘大受打击下变得浑浑噩噩，被徐老爷带回福建，从此不知所踪。原来当日万里被杀重伤未死，被艋林姓大户之女林阿雪所救，万里伤愈后感恩图报，遂娶阿雪为妻，并于艋重开忠义堂武馆，继承师门遗志，造福乡里.......
阿牛以双臂抱起火鼎达成飞虎的要求。阿牛跪下求万里，万里答应，阿牛因为烫伤晕过去。万里看到阿牛他胸前有跟他被水流走的儿子一样的胎记，怀疑阿牛是他的儿子，万里不顾飞虎、阿雪、玉树的反对，坚决收阿牛与天九为徒。玉红在日本学过医，以西医帮助阿牛医治，万里来探，阿牛感谢玉红及师父，万里问及其身世，阿牛将其水流一事全数告知，万里更加确定阿牛应是当年与惠娘所生之子，林逢春来将玉红带回，苦心劝玉红不可与阿牛交往。阿牛伤好，卻在双臂上留下双条飞龙的印记，万里慎重举行仪式，正式收阿牛与天九为弟子，且为阿牛取名为“飞龙”。飞虎、阿雪认为不可，飞虎为大弟子，阿牛怎可名为飞龙？飞虎生气离去。万里趁夜来找飞龙，并问他恨其生父 否？飞龙认为他们一定有不得已的苦衷，万里承诺以后不让飞龙受苦。 飞虎以训练为由，命飞龙与天九洗所有的衣服，玉红找来，得知姨父为阿牛取名为飞龙，替他感到高兴。玉树劝飞虎，他与玉红的婚事早已定下，要他不用担心。玉树表示愿意安排飞虎与玉红谈谈。玉树找来外国人的脚踏车，要飞虎骑，玉红在街上等不到玉树，竟巧遇飞龙与天九，飞虎在众人面前摔个四脚朝天，面子却挂不住，将气出在飞龙身上，将他又打了一顿。