共42集
明朝嘉靖年间，嘉靖帝昏庸无能，朝廷被严党把持，内部朝政腐败，沿海倭寇横行，整个朝野被牢牢掌控在严党党魁严嵩之子严世蕃的手中，明朝危在旦夕。少林寺观海方丈隐居达摩洞后，少林僧众既心忧国难，又对前程一片迷茫。少林新收的俗家弟子程闻道、高伯熊、海大力与严氏父子有灭门之仇，因天分极高，被分别安排到达摩堂，药局和般若堂苦修武功、医道和禅学。为了达到控制少林为己所用的目的，严世藩借平倭之名调走了少林武僧团，又勾结少林叛徒疯头陀霸占少林，把一方禅林净土变成了人间炼狱。练功有成的程闻道等人在观海大师的暗中帮助下，带领少林僧众与疯头陀和严党周旋，最后铲除了疯头陀，并协助朝中的正义之士扳倒了严氏父子。
第二天一早，剑雄来到校场口，而高寿昔早就跪在了那里。明德直言他知道昨晚是剑雄入狱救杨秀，并押来一些文人学士代替杨秀去死。而高寿昔一直跪在这里，就是为了恳求明德放了剑雄，自己去抵命。之后明德命人将杨秀押入大牢。
败火想要下山去找闻道，方丈不允许。这时通林醒来，知晓闻道下山后，通林为闻道求情，希望能够下山去救闻道。听后方丈颇有感触，允许败火下山找闻道。之后败火带着那三个和尚一起下山去找闻道了。
剑雄被押入大牢后，明德带着锦衣卫过来，掰折了剑雄的手指，以此惩罚他。并告知剑雄，两天前梁五去了无名庵，去找蓁蓁。明德是用蓁蓁来威胁剑雄归顺于他。高寿昔跪求明德放过剑雄，明德拿出奏折给高寿昔，说是由于国库空虚，让他来安排将盐税由两成增收至三成。为救剑雄，高寿昔不得不答应他这个要求。
蓁蓁到达无名庵后，却发现圆慈师太已死在庵内，正是昨晚梁五赶到无名庵，将其杀害。
闻道坐在马车里进城，赶到王府和程府时，发现都已经被查抄了。他走进程府，又想起了父亲之前在书房工作的模样。杨秀忽然出现，并偷爬入府，在院内挖着什么。闻道跟了过去，与他相认，得知闻道还活着的杨秀十分开心。杨秀将这段时间发生的事全部告诉闻道，闻道听闻后直言要杀了明德和严党。杨秀却说带着闻道去京城告御状，前面他挖的就是自己藏在院里的钱。之后外面传来官兵抓人的声响，近来明德已经杀了很多儒士。
剑雄赶来无名庵，想要救蓁蓁，可蓁蓁却误会是他杀了圆慈师太，气急的蓁蓁拔出剑雄的剑朝他挥砍了过去，剑雄躲过后，蓁蓁举剑想要自刎，剑雄上前阻止，让她赶紧逃跑。并告诉她闻道还活着，于是蓁蓁答应他，和他一起回南京。
败火带着那三个和尚下山，而那三个和尚在集市里寻找闻道时，却紧盯着各类糕点不愿离去，之后败火出现，给他们买了糕点吃，并带他们来到树林里的茅草屋过夜。
剑雄带着蓁蓁回到城里后，走到一处小吃摊位前，想起儿时曾带着蓁蓁来此吃过混沌，于是下马让蓁蓁去吃点东西。