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明朝中叶,老皇帝昏迷不醒,立储之事悬而未决,皇子和齐王觊觎皇位,明争暗斗,此时京城惊现连环杀人案,责成京师六扇门办理案件,六扇门统带申梓木本想和稀泥,却不想儿子申力行意外卷入案件当中,申梓木被迫带着申力行共同破案。申力行天赋异禀,很快破案,却也揭开了宫廷斗争的序幕。随着申力行调查的深入,案件牵扯越来越大,终于翻出了十多年前皇后犯下的一桩罪行,真相会影响皇位传承,也因为案件,申梓木被人暗害,申力行痛不欲生,却这时,皇帝病愈,齐王抓住机会将申力行破案的结果密奏皇上,龙颜大怒,皇子被软禁,齐王眼看即位,申力行突然发现杀死父亲的凶手是齐王的手下苏溢清,而这一切的缘起都是齐王所为,申力行为父报仇,将真相公之于众,逼得齐王走投无路起兵造反,在申力行的帮助下皇子平叛,最终顺利即位。
江陵向申力行透露道,那个被杀死的大烟鬼是自己养着的人。因为他觉得这个自宫了但是未能入宫的人和自己有几分相似,就让他作为自己的替身帮忙处理一些文物。然而出乎意料的是万柳居然生出歹意,谋财害命。不过也好,因为那时的江陵发现自己已经藏不住踪迹了,所以借此让自己“死”去,从而继续明哲保身。
经历了如此多的事情,申力行这才渐渐明白了父亲申梓木的良苦用心:京城凶险,风云诡谲,有时候不闻不问装糊涂的态度才能换来平安与生存。江陵更是以前辈的身份教导申力行,在这京城的环境中,仁慈是一剂毒药,非心狠无以生存。
经过万杨的一闹,要刑部抓紧时间行刑,徐蔚在摸不清对方目的的情况下,就真的不敢贸然断案了。刘吉指使徐蔚,任由万柳家人把事情闹大,从而把案子发回六扇门重审。万杨在听到案子要重新审理,待证据确凿再择日斩首万柳后,慌忙撤诉。万柳家人一撤诉,齐王的的计谋就露出了马脚。不甘心的齐王找万杨,又拿出大笔的钱财诱之以利,见利忘义的万杨不顾嫂子的反对,答应下来再到刑部告状。此时的刘吉已经恢复了冷静,他指使徐蔚稍安勿躁,冷眼旁观齐王接下来的举动。
在刑部把万柳案发回六扇门重审后,年轻而没有经验的言亦冬顿时乱了阵脚,他的决断要顾及师傅和申力行的安危,一时间进退维谷,案子的审理陷入了僵局。而且事情的发展脱离了齐王预先设计的轨道,这让齐王一时间也无可奈何,困窘不已。
为了掌握主动,齐王敦促赵无极去劝江陵早点面见皇帝,从而揭开皇后的当年犯下的滔天罪行,给皇子党以致命一击。赵无极的心思却很难揣测,他一以尚未报答江陵的恩情为借口拒绝了齐王要求,任然执意要按照自己规划计划前进。
齐王的线人来报,说松太医迷上了万花楼的姑娘,这一新消息使得齐王决定亲赴万花楼,一探究竟。但在齐王赶到万花楼的同时,刘吉的人孙乾碰巧也在万花楼。两方势力势成水火,而孙乾更是探听到了齐王要帮松太医赎回曹懿恩,作为交易要松太医尽心为家中的客人治病。这一宝贵的消息不时便会传入刘进的耳中。
刘进在返京途中路过田贵夫妇的客栈。田贵夫妇察觉出了刘进就是恩人申梓木要找的人,决定抓住他,但被刘进察觉,田贵夫妇遇害。