共40集
明朝中叶，老皇帝昏迷不醒，立储之事悬而未决，皇子和齐王觊觎皇位，明争暗斗，此时京城惊现连环杀人案，责成京师六扇门办理案件，六扇门统带申梓木本想和稀泥，却不想儿子申力行意外卷入案件当中，申梓木被迫带着申力行共同破案。申力行天赋异禀，很快破案，却也揭开了宫廷斗争的序幕。随着申力行调查的深入，案件牵扯越来越大，终于翻出了十多年前皇后犯下的一桩罪行，真相会影响皇位传承，也因为案件，申梓木被人暗害，申力行痛不欲生，却这时，皇帝病愈，齐王抓住机会将申力行破案的结果密奏皇上，龙颜大怒，皇子被软禁，齐王眼看即位，申力行突然发现杀死父亲的凶手是齐王的手下苏溢清，而这一切的缘起都是齐王所为，申力行为父报仇，将真相公之于众，逼得齐王走投无路起兵造反，在申力行的帮助下皇子平叛，最终顺利即位。
齐王应邀来到司礼监与赵无极会面密谋。赵无极质问齐王，现在松太医被杀，以后该由谁来给师娘焦溪看病。齐王则对赵无极说，当务之急是先扳倒刘吉一党，只有刘吉党人垮台，那时才能安安心心地寻访名医，治好焦溪的病。齐王又再次催促赵无极让江陵尽早进宫面见皇帝。
看到齐王与赵无极如此急于提审早已成废人的万柳，申力行意识到赵无极和齐王恐怕另有预谋。
刘吉在知晓了申力行和小栓子已经赶到刑部大牢，要求带走万柳提审后，他指使徐蔚马上找个借口处死万柳灭口。在陈大人的拖延下，徐蔚让人毒死了万柳兄弟。随后的申力行在看到了万柳兄弟已经被毒死后，悲伤不已。有太多的人因为卷入了政治斗争而遭受池鱼之殃。包括这个已经成为了废人的万柳。
申力行在从锦衣卫镇抚司回来的路上，遇到了候着自己的刘吉。刘吉想要和申力行谈合作，原因是双方有共同的仇人。也就是刘吉的党争仇人与申力行的杀父仇人为同一人。刘吉还告诉申力行，那个凶手此时就藏在齐王府当中。谁想，这次会面被齐王手下齐福在暗中看了个清清楚楚。
随后，申力行在离开齐王府后又发现苏溢清匆匆奔向王府中一座神秘别院，齐王手下齐福领着人守护在此，甚为严密。申力行见硬闯不行，便去讨好江陵夫妇，想从他们口中探听此院的情况。江陵非常隐晦地暗示申力行可以自己探查真相。可谁又曾想到，此时的齐王已经发现申力行对别院产生了兴趣。
心中有疑虑难解的申力行决定依江陵所言，自己查明真相。他带着言亦冬潜入别院，发现了齐王正在看一个女人演戏。言亦冬此时惊叫出声，引起了齐王的注意。申力行两人被王府侍卫抓住。齐王为了打消申力行的疑虑，编造了一系列的谎言欺骗申力行。但他不知道的是，申力行已经不再像以前那样对他言听计从，他已经开始怀疑齐王说的话。