共50集
本剧根据金庸同名小说改编，讲述了出身卑微的韦小宝如何成长发迹并最终归隐的故事。出身市井、刁钻油滑的韦小宝因偶然知悉宫中秘密，冒充小太监入宫，助康熙擒获权臣鳌拜而成莫逆，又被天地会总舵主陈近南收为弟子，却因陈要其剌杀康熙，令其左右为难。小宝无意中得知康熙先帝顺治仍在世，而被派赴五台山探望，施妙计令康熙父子团聚；并力助康熙，出使云南，成功揭露吴三桂勾结外族和邪教图谋造反的阴谋，助康熙平定三藩，剿灭神龙教；既助罗刹国苏菲娅公主成功夺权，又击退罗刹国入侵，迫使其签下和约。屡立奇功的小宝被封一等鹿鼎公，受到众多红颜知己的青睐，尽享齐人之福。康熙在江山大统后命小宝剿灭天地会，忠义难两全的小宝无奈退隐江湖。
回到皇宫韦小宝向康熙复命，他说自己按照皇上的旨意恩威并用把吴应熊治得服服帖帖，康熙听了甚是得意。韦小宝告诉皇上吴应熊给了自己五万两银票，他说自己跟着皇上这一辈子都不愁吃喝，他要把这些银子赏给侍卫们。
韦小宝奉皇上旨意来到多隆府上，把五万两银票交给多隆。他向多隆打听刺客里有没有一个叫刘一舟的人。多隆说刺客都不用真名的，但是他可以替小宝打听一下。回到尚膳监韦小宝告诉屏儿，自己已经派人去打听刘一舟的下落了，只要刘一舟活着他就一定能把他救出来。
天地会接到沐王府小公爷沐剑声的请柬，沐剑声要请他们赴宴，韦小宝决定带着弟兄们大胆走一趟。他们在沐王府见到了徐天川，徐大哥告诉他们自己被平西王的手下卢一峰掳走了，是沐剑声把他从平西王手下救出来的。
沐王府仍然要天地会为白寒松的死给一个说法。徐天川说是自己误杀了白大侠要一命抵一命。韦小宝暗示沐剑声昨晚皇宫进了刺客，其中三个被抓已关进大牢。自己以为那些刺客是沐王府的人还让朋友好好照顾他们，沐剑声说那些刺客有可能是吴应熊派去的，韦小宝说那他就不必关照这些刺客了，本来他以为刺客是沐王府的人还准备搭救一两个出来的。听韦小宝这么一说沐剑声只好承认刺客是沐王府的人，并请求韦小宝帮忙救出自己手下。沐剑声还说自己的妹妹已经失踪多日也让韦小宝帮着寻找。
回到皇宫康熙问韦小宝这一天不见人影，都干什么去了，韦小宝说他去外面打听刺客的消息了，康熙说韦小宝这样漫无目的的打探是白费工夫，自己倒有一个办法可以试一试。康熙要韦小宝假意放了刺客，然后放长线钓大鱼找到幕后主使。康熙要小宝把戏演得逼真一些，小宝说自己为皇上办事忠心耿耿，以后若是自己做错了事激怒了皇上，皇上一定要饶他一命。康熙说只要小宝忠于自己，他就不会怪罪小宝。
晚上韦小宝来到天牢，狱卒们说这三个刺客嘴严的很，什么都不肯说。韦小宝告诉三个刺客是一个姓沐的和一个姓柳的，还有自己的老婆方怡拜托自己前来搭救他们的。