共50集
本剧根据金庸同名小说改编，讲述了出身卑微的韦小宝如何成长发迹并最终归隐的故事。出身市井、刁钻油滑的韦小宝因偶然知悉宫中秘密，冒充小太监入宫，助康熙擒获权臣鳌拜而成莫逆，又被天地会总舵主陈近南收为弟子，却因陈要其剌杀康熙，令其左右为难。小宝无意中得知康熙先帝顺治仍在世，而被派赴五台山探望，施妙计令康熙父子团聚；并力助康熙，出使云南，成功揭露吴三桂勾结外族和邪教图谋造反的阴谋，助康熙平定三藩，剿灭神龙教；既助罗刹国苏菲娅公主成功夺权，又击退罗刹国入侵，迫使其签下和约。屡立奇功的小宝被封一等鹿鼎公，受到众多红颜知己的青睐，尽享齐人之福。康熙在江山大统后命小宝剿灭天地会，忠义难两全的小宝无奈退隐江湖。
胖头陀逼着韦小宝说出其他四十二章经的下落，韦小宝看到一个农家小院中立了一块石碑，他假装惊喜说其他七本四十二章经的下落都写在这个石碑上，而且石碑上还刻着“洪教主寿与天齐”，胖头陀信以为真，要把碑文拓了回去向洪教主请功。
少林高僧一路护送韦小宝和双儿回到京城。为了防止经书被盗韦小宝把经书藏在客栈的墙砖之内。韦小宝准备带双儿到京城好好玩一玩，马车却把他们带到一个陌生的地方。
在这里小宝见到了方怡，方怡说她要和韦小宝到神仙岛去玩儿，结果一上岛二人就被毒蛇咬晕了。韦小宝被一个叫陆高轩的老先生救了，陆高轩说他已经昏迷了三天三夜。陆高轩也是神龙教徒，他逼韦小宝把碑文的内容翻译出来，韦小宝只得说自己大字不识一个，这些都是他信口胡诌的。可是胖头陀已经把碑文的事情报告给了洪教主，洪教主还要面见韦小宝。
韦小宝和胖头陀、陆高轩二人一起来到神龙教。因为洪教主受夫人唆使残杀创教成员，引得青龙使和白龙使的不满，青龙使蓄谋已久，在刀上抹了毒药。这种毒药碰上雄黄酒就会化作一种浓香让人筋骨尽散，气力全无。神龙教成员为了防蛇，每天都要喝雄黄酒，在场的所有神龙教众全部中毒躺在地上不能动弹，唯独韦小宝没有喝雄黄酒所以安然无恙。
陆先生让韦小宝趁此机会杀了洪教主和夫人。旁边一个中毒的侍女却告诉小宝不能杀教主和夫人。韦小宝一看原来是沐剑屏，当时在鬼宅他们被神龙教的人掳了去，屏儿告诉韦小宝洪教主在每个神龙教徒身上都下了毒，如果杀了教主大家的性命都不保。为了笼络韦小宝洪夫人让洪教主赐韦小宝一个职位，洪教主封韦小宝为神龙教白龙使。