共50集
本剧根据金庸同名小说改编，讲述了出身卑微的韦小宝如何成长发迹并最终归隐的故事。出身市井、刁钻油滑的韦小宝因偶然知悉宫中秘密，冒充小太监入宫，助康熙擒获权臣鳌拜而成莫逆，又被天地会总舵主陈近南收为弟子，却因陈要其剌杀康熙，令其左右为难。小宝无意中得知康熙先帝顺治仍在世，而被派赴五台山探望，施妙计令康熙父子团聚；并力助康熙，出使云南，成功揭露吴三桂勾结外族和邪教图谋造反的阴谋，助康熙平定三藩，剿灭神龙教；既助罗刹国苏菲娅公主成功夺权，又击退罗刹国入侵，迫使其签下和约。屡立奇功的小宝被封一等鹿鼎公，受到众多红颜知己的青睐，尽享齐人之福。康熙在江山大统后命小宝剿灭天地会，忠义难两全的小宝无奈退隐江湖。
来到慈宁宫皇太后急忙问韦小宝此次把自己今年的解药带来了没有，韦小宝说自己也吃了洪教主的豹胎易经丸，教主没有向自己提及此事。为了讨好韦小宝皇太后把30颗雪参玉蟾丸送给了韦小宝。韦小宝告诉皇太后洪教主此次派自己回宫是为了寻找四十二章经。
康熙任命韦小宝为骁骑营副都统，让韦小宝带着骁骑营前往少林寺宣旨。韦小宝在军中无聊，他召集官兵和自己赌钱。山上王屋派司徒掌门看到山下驻扎着清兵，以为这些官兵会对王屋派不利。他派自己的儿子和侄女曾柔二人到军营中刺探情况，军中官兵都在赌钱守卫松懈，曾柔挟制了韦小宝，韦小宝假装投降趁其不备偷袭曾柔，控制了她。韦小宝怕这二人与天地会有关，他故意要和曾柔掷色子比大小，有心放了他俩。曾柔知道小宝是故意输给他，她让韦小宝把这三个色子留给自己做纪念。
沐剑声带着手下也来到王屋派，他告诉司徒掌门顺治皇帝在五台山清凉寺出家，康熙一定会前去探望顺治，到时他们可以一举除掉大小两个皇帝。曾柔告诉司徒掌门和沐剑声骁骑营的统领名叫韦小宝，沐剑声听后很是惊讶。
韦小宝带着骁骑营来到少林寺宣读圣旨。康熙在圣旨上让韦小宝代替自己出家，少林寺方丈给韦小宝起了个法号叫晦明，和方丈同辈。韦小宝虽然心里有一百个不愿意也只得服从，乖乖地落了发穿上了迦裟。
宫里所有人都知道皇上准备去五台山朝见老皇爷，可是康熙就是不来告诉皇太后。皇太后猜测韦小宝已经把自己的事情告诉了皇上，她心生一计，告诉建宁如果皇上去五台山她们母女也要跟着去。
阿珂和师姐来到少林寺探查和寺内僧人交上了手，韦小宝见阿珂貌美如花不由心动。